Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8S4

Rexo2, Oligoribonuclease, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo2Q9D8S4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rexo2Q9D8S4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rexo2Q9D8S4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rexo2Q9D8S4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rexo2Q9D8S4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Rexo2Q9D8S4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rexo2Q9D8S4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rexo2Q9D8S4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rexo2Q9D8S4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rexo2Q9D8S4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rexo2Q9D8S4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Rexo2Q9D8S4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rexo2Q9D8S4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rexo2Q9D8S4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rexo2Q9D8S4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rexo2Q9D8S4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rexo2Q9D8S4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Rexo2Q9D8S4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rexo2Q9D8S4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rexo2Q9D8S4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rexo2Q9D8S4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rexo2Q9D8S4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rexo2Q9D8S4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Rexo2Q9D8S4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rexo2Q9D8S4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rexo2Q9D8S4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rexo2Q9D8S4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rexo2Q9D8S4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rexo2Q9D8S4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rexo2Q9D8S4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rexo2Q9D8S4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rexo2Q9D8S4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Rexo2Q9D8S4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rexo2Q9D8S4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Rexo2Q9D8S4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rexo2Q9D8S4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rexo2Q9D8S4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rexo2Q9D8S4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rexo2Q9D8S4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rexo2Q9D8S4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rexo2Q9D8S4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rexo2Q9D8S4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rexo2Q9D8S4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rexo2Q9D8S4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rexo2Q9D8S4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rexo2Q9D8S4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rexo2Q9D8S4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rexo2Q9D8S4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rexo2Q9D8S4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rexo2Q9D8S4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rexo2Q9D8S4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rexo2Q9D8S4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rexo2Q9D8S4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rexo2Q9D8S4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rexo2Q9D8S4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Rexo2Q9D8S4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rexo2Q9D8S4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rexo2Q9D8S4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rexo2Q9D8S4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rexo2Q9D8S4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rexo2Q9D8S4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rexo2Q9D8S4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rexo2Q9D8S4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Rexo2Q9D8S4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rexo2Q9D8S4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rexo2Q9D8S4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rexo2Q9D8S4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rexo2Q9D8S4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rexo2Q9D8S4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rexo2Q9D8S4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rexo2Q9D8S4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rexo2Q9D8S4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rexo2Q9D8S4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rexo2Q9D8S4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rexo2Q9D8S4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rexo2Q9D8S4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rexo2Q9D8S4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rexo2Q9D8S4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rexo2Q9D8S4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rexo2Q9D8S4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rexo2Q9D8S4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rexo2Q9D8S4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rexo2Q9D8S4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Rexo2Q9D8S4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rexo2Q9D8S4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rexo2Q9D8S4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rexo2Q9D8S4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rexo2Q9D8S4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rexo2Q9D8S4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rexo2Q9D8S4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rexo2Q9D8S4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rexo2Q9D8S4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rexo2Q9D8S4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rexo2Q9D8S4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rexo2Q9D8S4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rexo2Q9D8S4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rexo2Q9D8S4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rexo2Q9D8S4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rexo2Q9D8S4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rexo2Q9D8S4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108 ms