Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8Q6

Uncharacterized protein C11orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8Q6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D8Q6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D8Q6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D8Q6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D8Q6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9D8Q6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9D8Q6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D8Q6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D8Q6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D8Q6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D8Q6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D8Q6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D8Q6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D8Q6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D8Q6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9D8Q6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9D8Q6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q9D8Q6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q9D8Q6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9D8Q6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9D8Q6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9D8Q6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9D8Q6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D8Q6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D8Q6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D8Q6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D8Q6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D8Q6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D8Q6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D8Q6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D8Q6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D8Q6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D8Q6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D8Q6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D8Q6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D8Q6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D8Q6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D8Q6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D8Q6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D8Q6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D8Q6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D8Q6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D8Q6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Q9D8Q6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D8Q6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D8Q6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D8Q6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D8Q6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9D8Q6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9D8Q6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9D8Q6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9D8Q6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9D8Q6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9D8Q6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9D8Q6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9D8Q6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9D8Q6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9D8Q6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9D8Q6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9D8Q6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9D8Q6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9D8Q6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9D8Q6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9D8Q6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9D8Q6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9D8Q6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9D8Q6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9D8Q6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q9D8Q6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q9D8Q6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q9D8Q6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q9D8Q6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9D8Q6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9D8Q6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9D8Q6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9D8Q6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9D8Q6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9D8Q6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9D8Q6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9D8Q6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9D8Q6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9D8Q6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9D8Q6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9D8Q6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9D8Q6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9D8Q6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9D8Q6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9D8Q6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9D8Q6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9D8Q6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9D8Q6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9D8Q6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9D8Q6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D8Q6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D8Q6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D8Q6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9D8Q6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9D8Q6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9D8Q6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9D8Q6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.3 ms