Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7X1

Kctd4, BTB/POZ domain-containing protein KCTD4, mousemouse

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kctd4Q9D7X1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kctd4Q9D7X1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kctd4Q9D7X1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kctd4Q9D7X1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kctd4Q9D7X1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kctd4Q9D7X1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kctd4Q9D7X1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kctd4Q9D7X1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kctd4Q9D7X1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Kctd4Q9D7X1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Kctd4Q9D7X1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kctd4Q9D7X1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kctd4Q9D7X1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kctd4Q9D7X1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kctd4Q9D7X1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kctd4Q9D7X1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kctd4Q9D7X1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kctd4Q9D7X1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kctd4Q9D7X1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kctd4Q9D7X1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kctd4Q9D7X1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kctd4Q9D7X1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kctd4Q9D7X1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kctd4Q9D7X1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Kctd4Q9D7X1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Kctd4Q9D7X1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Kctd4Q9D7X1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kctd4Q9D7X1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kctd4Q9D7X1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kctd4Q9D7X1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kctd4Q9D7X1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kctd4Q9D7X1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kctd4Q9D7X1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kctd4Q9D7X1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kctd4Q9D7X1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kctd4Q9D7X1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kctd4Q9D7X1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kctd4Q9D7X1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kctd4Q9D7X1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kctd4Q9D7X1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kctd4Q9D7X1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kctd4Q9D7X1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Kctd4Q9D7X1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Kctd4Q9D7X1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Kctd4Q9D7X1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Kctd4Q9D7X1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Kctd4Q9D7X1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Kctd4Q9D7X1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Kctd4Q9D7X1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kctd4Q9D7X1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kctd4Q9D7X1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kctd4Q9D7X1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kctd4Q9D7X1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kctd4Q9D7X1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kctd4Q9D7X1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kctd4Q9D7X1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kctd4Q9D7X1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kctd4Q9D7X1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kctd4Q9D7X1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kctd4Q9D7X1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kctd4Q9D7X1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kctd4Q9D7X1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kctd4Q9D7X1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kctd4Q9D7X1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kctd4Q9D7X1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kctd4Q9D7X1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kctd4Q9D7X1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Kctd4Q9D7X1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kctd4Q9D7X1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kctd4Q9D7X1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kctd4Q9D7X1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kctd4Q9D7X1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Kctd4Q9D7X1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kctd4Q9D7X1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kctd4Q9D7X1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kctd4Q9D7X1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kctd4Q9D7X1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kctd4Q9D7X1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kctd4Q9D7X1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kctd4Q9D7X1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kctd4Q9D7X1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kctd4Q9D7X1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kctd4Q9D7X1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Kctd4Q9D7X1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kctd4Q9D7X1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Kctd4Q9D7X1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kctd4Q9D7X1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kctd4Q9D7X1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kctd4Q9D7X1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kctd4Q9D7X1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kctd4Q9D7X1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kctd4Q9D7X1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kctd4Q9D7X1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kctd4Q9D7X1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kctd4Q9D7X1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kctd4Q9D7X1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kctd4Q9D7X1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kctd4Q9D7X1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kctd4Q9D7X1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kctd4Q9D7X1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms