Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7M8

Polr2d, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2dQ9D7M8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Polr2dQ9D7M8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Polr2dQ9D7M8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Polr2dQ9D7M8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Polr2dQ9D7M8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Polr2dQ9D7M8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Polr2dQ9D7M8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Polr2dQ9D7M8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Polr2dQ9D7M8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Polr2dQ9D7M8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Polr2dQ9D7M8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Polr2dQ9D7M8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Polr2dQ9D7M8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Polr2dQ9D7M8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Polr2dQ9D7M8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Polr2dQ9D7M8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Polr2dQ9D7M8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Polr2dQ9D7M8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Polr2dQ9D7M8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Polr2dQ9D7M8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Polr2dQ9D7M8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Polr2dQ9D7M8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Polr2dQ9D7M8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Polr2dQ9D7M8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Polr2dQ9D7M8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Polr2dQ9D7M8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Polr2dQ9D7M8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Polr2dQ9D7M8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Polr2dQ9D7M8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Polr2dQ9D7M8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Polr2dQ9D7M8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Polr2dQ9D7M8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Polr2dQ9D7M8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Polr2dQ9D7M8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Polr2dQ9D7M8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Polr2dQ9D7M8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Polr2dQ9D7M8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Polr2dQ9D7M8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Polr2dQ9D7M8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Polr2dQ9D7M8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Polr2dQ9D7M8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Polr2dQ9D7M8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Polr2dQ9D7M8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Polr2dQ9D7M8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Polr2dQ9D7M8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Polr2dQ9D7M8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Polr2dQ9D7M8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Polr2dQ9D7M8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Polr2dQ9D7M8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Polr2dQ9D7M8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Polr2dQ9D7M8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Polr2dQ9D7M8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Polr2dQ9D7M8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Polr2dQ9D7M8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Polr2dQ9D7M8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Polr2dQ9D7M8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Polr2dQ9D7M8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Polr2dQ9D7M8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Polr2dQ9D7M8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Polr2dQ9D7M8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Polr2dQ9D7M8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Polr2dQ9D7M8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Polr2dQ9D7M8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Polr2dQ9D7M8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Polr2dQ9D7M8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Polr2dQ9D7M8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Polr2dQ9D7M8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Polr2dQ9D7M8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Polr2dQ9D7M8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Polr2dQ9D7M8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Polr2dQ9D7M8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Polr2dQ9D7M8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Polr2dQ9D7M8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Polr2dQ9D7M8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Polr2dQ9D7M8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Polr2dQ9D7M8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Polr2dQ9D7M8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Polr2dQ9D7M8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Polr2dQ9D7M8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Polr2dQ9D7M8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Polr2dQ9D7M8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Polr2dQ9D7M8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Polr2dQ9D7M8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Polr2dQ9D7M8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Polr2dQ9D7M8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Polr2dQ9D7M8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Polr2dQ9D7M8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Polr2dQ9D7M8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Polr2dQ9D7M8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Polr2dQ9D7M8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Polr2dQ9D7M8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Polr2dQ9D7M8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Polr2dQ9D7M8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Polr2dQ9D7M8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Polr2dQ9D7M8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Polr2dQ9D7M8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Polr2dQ9D7M8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Polr2dQ9D7M8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Polr2dQ9D7M8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Polr2dQ9D7M8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms