Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6K8

Fundc2, FUN14 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc2Q9D6K8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Fundc2Q9D6K8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Fundc2Q9D6K8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Fundc2Q9D6K8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Fundc2Q9D6K8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fundc2Q9D6K8 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Fundc2Q9D6K8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fundc2Q9D6K8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fundc2Q9D6K8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fundc2Q9D6K8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fundc2Q9D6K8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fundc2Q9D6K8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Fundc2Q9D6K8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Fundc2Q9D6K8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fundc2Q9D6K8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fundc2Q9D6K8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fundc2Q9D6K8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fundc2Q9D6K8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fundc2Q9D6K8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fundc2Q9D6K8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fundc2Q9D6K8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fundc2Q9D6K8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fundc2Q9D6K8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fundc2Q9D6K8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fundc2Q9D6K8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fundc2Q9D6K8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Fundc2Q9D6K8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fundc2Q9D6K8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fundc2Q9D6K8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fundc2Q9D6K8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fundc2Q9D6K8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fundc2Q9D6K8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fundc2Q9D6K8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fundc2Q9D6K8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fundc2Q9D6K8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fundc2Q9D6K8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fundc2Q9D6K8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fundc2Q9D6K8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fundc2Q9D6K8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fundc2Q9D6K8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fundc2Q9D6K8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fundc2Q9D6K8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fundc2Q9D6K8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fundc2Q9D6K8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fundc2Q9D6K8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fundc2Q9D6K8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fundc2Q9D6K8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fundc2Q9D6K8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fundc2Q9D6K8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fundc2Q9D6K8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fundc2Q9D6K8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fundc2Q9D6K8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fundc2Q9D6K8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fundc2Q9D6K8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fundc2Q9D6K8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fundc2Q9D6K8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fundc2Q9D6K8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fundc2Q9D6K8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fundc2Q9D6K8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fundc2Q9D6K8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fundc2Q9D6K8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fundc2Q9D6K8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fundc2Q9D6K8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fundc2Q9D6K8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fundc2Q9D6K8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fundc2Q9D6K8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Fundc2Q9D6K8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Fundc2Q9D6K8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Fundc2Q9D6K8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Fundc2Q9D6K8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Fundc2Q9D6K8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fundc2Q9D6K8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fundc2Q9D6K8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fundc2Q9D6K8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fundc2Q9D6K8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fundc2Q9D6K8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fundc2Q9D6K8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fundc2Q9D6K8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fundc2Q9D6K8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Fundc2Q9D6K8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fundc2Q9D6K8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fundc2Q9D6K8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fundc2Q9D6K8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fundc2Q9D6K8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fundc2Q9D6K8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fundc2Q9D6K8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fundc2Q9D6K8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fundc2Q9D6K8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fundc2Q9D6K8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fundc2Q9D6K8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fundc2Q9D6K8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fundc2Q9D6K8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fundc2Q9D6K8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fundc2Q9D6K8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fundc2Q9D6K8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fundc2Q9D6K8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fundc2Q9D6K8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fundc2Q9D6K8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fundc2Q9D6K8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fundc2Q9D6K8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms