Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc83Q9D4V3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc83Q9D4V3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc83Q9D4V3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc83Q9D4V3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc83Q9D4V3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc83Q9D4V3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ccdc83Q9D4V3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc83Q9D4V3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc83Q9D4V3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc83Q9D4V3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc83Q9D4V3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc83Q9D4V3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc83Q9D4V3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc83Q9D4V3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc83Q9D4V3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc83Q9D4V3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc83Q9D4V3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc83Q9D4V3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc83Q9D4V3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc83Q9D4V3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc83Q9D4V3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc83Q9D4V3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc83Q9D4V3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc83Q9D4V3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc83Q9D4V3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc83Q9D4V3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc83Q9D4V3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc83Q9D4V3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc83Q9D4V3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc83Q9D4V3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc83Q9D4V3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc83Q9D4V3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc83Q9D4V3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc83Q9D4V3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc83Q9D4V3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc83Q9D4V3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc83Q9D4V3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc83Q9D4V3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc83Q9D4V3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc83Q9D4V3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc83Q9D4V3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc83Q9D4V3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc83Q9D4V3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc83Q9D4V3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc83Q9D4V3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc83Q9D4V3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc83Q9D4V3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc83Q9D4V3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc83Q9D4V3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc83Q9D4V3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc83Q9D4V3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc83Q9D4V3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc83Q9D4V3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc83Q9D4V3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc83Q9D4V3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc83Q9D4V3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc83Q9D4V3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc83Q9D4V3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc83Q9D4V3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc83Q9D4V3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc83Q9D4V3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc83Q9D4V3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc83Q9D4V3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc83Q9D4V3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc83Q9D4V3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc83Q9D4V3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc83Q9D4V3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc83Q9D4V3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc83Q9D4V3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc83Q9D4V3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc83Q9D4V3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc83Q9D4V3 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc83Q9D4V3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc83Q9D4V3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc83Q9D4V3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc83Q9D4V3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc83Q9D4V3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc83Q9D4V3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc83Q9D4V3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc83Q9D4V3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc83Q9D4V3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc83Q9D4V3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc83Q9D4V3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc83Q9D4V3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc83Q9D4V3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc83Q9D4V3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc83Q9D4V3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc83Q9D4V3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc83Q9D4V3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc83Q9D4V3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc83Q9D4V3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc83Q9D4V3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc83Q9D4V3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc83Q9D4V3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc83Q9D4V3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc83Q9D4V3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc83Q9D4V3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc83Q9D4V3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc83Q9D4V3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms