Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H2

Gcc1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc1Q9D4H2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Gcc1Q9D4H2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Gcc1Q9D4H2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Gcc1Q9D4H2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Gcc1Q9D4H2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Gcc1Q9D4H2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Gcc1Q9D4H2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Gcc1Q9D4H2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Gcc1Q9D4H2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Gcc1Q9D4H2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Gcc1Q9D4H2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Gcc1Q9D4H2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Gcc1Q9D4H2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Gcc1Q9D4H2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Gcc1Q9D4H2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Gcc1Q9D4H2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Gcc1Q9D4H2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Gcc1Q9D4H2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Gcc1Q9D4H2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Gcc1Q9D4H2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Gcc1Q9D4H2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Gcc1Q9D4H2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Gcc1Q9D4H2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Gcc1Q9D4H2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Gcc1Q9D4H2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Gcc1Q9D4H2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Gcc1Q9D4H2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Gcc1Q9D4H2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Gcc1Q9D4H2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Gcc1Q9D4H2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Gcc1Q9D4H2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Gcc1Q9D4H2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Gcc1Q9D4H2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Gcc1Q9D4H2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Gcc1Q9D4H2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Gcc1Q9D4H2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Gcc1Q9D4H2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Gcc1Q9D4H2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Gcc1Q9D4H2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Gcc1Q9D4H2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Gcc1Q9D4H2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Gcc1Q9D4H2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Gcc1Q9D4H2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Gcc1Q9D4H2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Gcc1Q9D4H2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Gcc1Q9D4H2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Gcc1Q9D4H2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Gcc1Q9D4H2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Gcc1Q9D4H2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Gcc1Q9D4H2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Gcc1Q9D4H2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Gcc1Q9D4H2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Gcc1Q9D4H2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Gcc1Q9D4H2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Gcc1Q9D4H2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Gcc1Q9D4H2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Gcc1Q9D4H2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Gcc1Q9D4H2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Gcc1Q9D4H2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Gcc1Q9D4H2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Gcc1Q9D4H2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Gcc1Q9D4H2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Gcc1Q9D4H2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Gcc1Q9D4H2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Gcc1Q9D4H2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Gcc1Q9D4H2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Gcc1Q9D4H2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Gcc1Q9D4H2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Gcc1Q9D4H2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Gcc1Q9D4H2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Gcc1Q9D4H2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Gcc1Q9D4H2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Gcc1Q9D4H2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Gcc1Q9D4H2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Gcc1Q9D4H2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Gcc1Q9D4H2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Gcc1Q9D4H2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Gcc1Q9D4H2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Gcc1Q9D4H2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Gcc1Q9D4H2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Gcc1Q9D4H2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Gcc1Q9D4H2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Gcc1Q9D4H2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Gcc1Q9D4H2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Gcc1Q9D4H2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Gcc1Q9D4H2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Gcc1Q9D4H2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Gcc1Q9D4H2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Gcc1Q9D4H2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Gcc1Q9D4H2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Gcc1Q9D4H2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Gcc1Q9D4H2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Gcc1Q9D4H2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Gcc1Q9D4H2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Gcc1Q9D4H2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Gcc1Q9D4H2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Gcc1Q9D4H2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Gcc1Q9D4H2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Gcc1Q9D4H2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Gcc1Q9D4H2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.8 ms