Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X3

4933428M09Rik, RIKEN cDNA 4933428M09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428M09RikQ9D3X3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
4933428M09RikQ9D3X3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
4933428M09RikQ9D3X3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
4933428M09RikQ9D3X3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
4933428M09RikQ9D3X3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
4933428M09RikQ9D3X3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
4933428M09RikQ9D3X3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
4933428M09RikQ9D3X3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
4933428M09RikQ9D3X3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
4933428M09RikQ9D3X3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
4933428M09RikQ9D3X3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
4933428M09RikQ9D3X3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
4933428M09RikQ9D3X3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
4933428M09RikQ9D3X3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
4933428M09RikQ9D3X3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
4933428M09RikQ9D3X3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
4933428M09RikQ9D3X3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
4933428M09RikQ9D3X3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
4933428M09RikQ9D3X3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
4933428M09RikQ9D3X3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
4933428M09RikQ9D3X3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
4933428M09RikQ9D3X3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
4933428M09RikQ9D3X3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
4933428M09RikQ9D3X3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
4933428M09RikQ9D3X3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
4933428M09RikQ9D3X3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
4933428M09RikQ9D3X3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
4933428M09RikQ9D3X3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
4933428M09RikQ9D3X3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
4933428M09RikQ9D3X3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
4933428M09RikQ9D3X3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
4933428M09RikQ9D3X3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
4933428M09RikQ9D3X3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
4933428M09RikQ9D3X3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
4933428M09RikQ9D3X3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
4933428M09RikQ9D3X3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
4933428M09RikQ9D3X3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
4933428M09RikQ9D3X3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
4933428M09RikQ9D3X3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
4933428M09RikQ9D3X3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
4933428M09RikQ9D3X3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
4933428M09RikQ9D3X3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
4933428M09RikQ9D3X3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
4933428M09RikQ9D3X3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
4933428M09RikQ9D3X3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
4933428M09RikQ9D3X3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
4933428M09RikQ9D3X3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
4933428M09RikQ9D3X3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
4933428M09RikQ9D3X3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
4933428M09RikQ9D3X3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
4933428M09RikQ9D3X3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4933428M09RikQ9D3X3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4933428M09RikQ9D3X3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
4933428M09RikQ9D3X3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
4933428M09RikQ9D3X3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4933428M09RikQ9D3X3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
4933428M09RikQ9D3X3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
4933428M09RikQ9D3X3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
4933428M09RikQ9D3X3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
4933428M09RikQ9D3X3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
4933428M09RikQ9D3X3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
4933428M09RikQ9D3X3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
4933428M09RikQ9D3X3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
4933428M09RikQ9D3X3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
4933428M09RikQ9D3X3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
4933428M09RikQ9D3X3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
4933428M09RikQ9D3X3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
4933428M09RikQ9D3X3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
4933428M09RikQ9D3X3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
4933428M09RikQ9D3X3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
4933428M09RikQ9D3X3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
4933428M09RikQ9D3X3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
4933428M09RikQ9D3X3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
4933428M09RikQ9D3X3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
4933428M09RikQ9D3X3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
4933428M09RikQ9D3X3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
4933428M09RikQ9D3X3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
4933428M09RikQ9D3X3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
4933428M09RikQ9D3X3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
4933428M09RikQ9D3X3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
4933428M09RikQ9D3X3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
4933428M09RikQ9D3X3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
4933428M09RikQ9D3X3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
4933428M09RikQ9D3X3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
4933428M09RikQ9D3X3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
4933428M09RikQ9D3X3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4933428M09RikQ9D3X3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
4933428M09RikQ9D3X3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4933428M09RikQ9D3X3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4933428M09RikQ9D3X3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
4933428M09RikQ9D3X3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
4933428M09RikQ9D3X3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4933428M09RikQ9D3X3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
4933428M09RikQ9D3X3 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
4933428M09RikQ9D3X3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
4933428M09RikQ9D3X3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
4933428M09RikQ9D3X3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
4933428M09RikQ9D3X3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms