Protein–RNA interactions for Protein: Q9D226

Krtap5-3, Keratin-associated protein 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap5-3Q9D226 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Krtap5-3Q9D226 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Krtap5-3Q9D226 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Krtap5-3Q9D226 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Krtap5-3Q9D226 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Krtap5-3Q9D226 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Krtap5-3Q9D226 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Krtap5-3Q9D226 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Krtap5-3Q9D226 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Krtap5-3Q9D226 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Krtap5-3Q9D226 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Krtap5-3Q9D226 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Krtap5-3Q9D226 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Krtap5-3Q9D226 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Krtap5-3Q9D226 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Krtap5-3Q9D226 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Krtap5-3Q9D226 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Krtap5-3Q9D226 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Krtap5-3Q9D226 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Krtap5-3Q9D226 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Krtap5-3Q9D226 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Krtap5-3Q9D226 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Krtap5-3Q9D226 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Krtap5-3Q9D226 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Krtap5-3Q9D226 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Krtap5-3Q9D226 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Krtap5-3Q9D226 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Krtap5-3Q9D226 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Krtap5-3Q9D226 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Krtap5-3Q9D226 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Krtap5-3Q9D226 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Krtap5-3Q9D226 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Krtap5-3Q9D226 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Krtap5-3Q9D226 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Krtap5-3Q9D226 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Krtap5-3Q9D226 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Krtap5-3Q9D226 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Krtap5-3Q9D226 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Krtap5-3Q9D226 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Krtap5-3Q9D226 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Krtap5-3Q9D226 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Krtap5-3Q9D226 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Krtap5-3Q9D226 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Krtap5-3Q9D226 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Krtap5-3Q9D226 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Krtap5-3Q9D226 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Krtap5-3Q9D226 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Krtap5-3Q9D226 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Krtap5-3Q9D226 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Krtap5-3Q9D226 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Krtap5-3Q9D226 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Krtap5-3Q9D226 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Krtap5-3Q9D226 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Krtap5-3Q9D226 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Krtap5-3Q9D226 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Krtap5-3Q9D226 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Krtap5-3Q9D226 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Krtap5-3Q9D226 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Krtap5-3Q9D226 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Krtap5-3Q9D226 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Krtap5-3Q9D226 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Krtap5-3Q9D226 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Krtap5-3Q9D226 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Krtap5-3Q9D226 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Krtap5-3Q9D226 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Krtap5-3Q9D226 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Krtap5-3Q9D226 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Krtap5-3Q9D226 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Krtap5-3Q9D226 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Krtap5-3Q9D226 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Krtap5-3Q9D226 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Krtap5-3Q9D226 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Krtap5-3Q9D226 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Krtap5-3Q9D226 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Krtap5-3Q9D226 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Krtap5-3Q9D226 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Krtap5-3Q9D226 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Krtap5-3Q9D226 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Krtap5-3Q9D226 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Krtap5-3Q9D226 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Krtap5-3Q9D226 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Krtap5-3Q9D226 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Krtap5-3Q9D226 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Krtap5-3Q9D226 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Krtap5-3Q9D226 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Krtap5-3Q9D226 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Krtap5-3Q9D226 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Krtap5-3Q9D226 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Krtap5-3Q9D226 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Krtap5-3Q9D226 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Krtap5-3Q9D226 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Krtap5-3Q9D226 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Krtap5-3Q9D226 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Krtap5-3Q9D226 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Krtap5-3Q9D226 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Krtap5-3Q9D226 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Krtap5-3Q9D226 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Krtap5-3Q9D226 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Krtap5-3Q9D226 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Krtap5-3Q9D226 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.1 ms