Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1D6

Cthrc1, Collagen triple helix repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cthrc1Q9D1D6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cthrc1Q9D1D6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Cthrc1Q9D1D6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cthrc1Q9D1D6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cthrc1Q9D1D6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cthrc1Q9D1D6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cthrc1Q9D1D6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cthrc1Q9D1D6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cthrc1Q9D1D6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cthrc1Q9D1D6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cthrc1Q9D1D6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cthrc1Q9D1D6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cthrc1Q9D1D6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cthrc1Q9D1D6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cthrc1Q9D1D6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cthrc1Q9D1D6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cthrc1Q9D1D6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cthrc1Q9D1D6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cthrc1Q9D1D6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cthrc1Q9D1D6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cthrc1Q9D1D6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Cthrc1Q9D1D6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Cthrc1Q9D1D6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cthrc1Q9D1D6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cthrc1Q9D1D6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cthrc1Q9D1D6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Cthrc1Q9D1D6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cthrc1Q9D1D6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cthrc1Q9D1D6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cthrc1Q9D1D6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cthrc1Q9D1D6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cthrc1Q9D1D6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cthrc1Q9D1D6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Cthrc1Q9D1D6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cthrc1Q9D1D6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cthrc1Q9D1D6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cthrc1Q9D1D6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cthrc1Q9D1D6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cthrc1Q9D1D6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cthrc1Q9D1D6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cthrc1Q9D1D6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cthrc1Q9D1D6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cthrc1Q9D1D6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cthrc1Q9D1D6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cthrc1Q9D1D6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cthrc1Q9D1D6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cthrc1Q9D1D6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cthrc1Q9D1D6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cthrc1Q9D1D6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cthrc1Q9D1D6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cthrc1Q9D1D6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cthrc1Q9D1D6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cthrc1Q9D1D6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cthrc1Q9D1D6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cthrc1Q9D1D6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cthrc1Q9D1D6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cthrc1Q9D1D6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cthrc1Q9D1D6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cthrc1Q9D1D6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cthrc1Q9D1D6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cthrc1Q9D1D6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cthrc1Q9D1D6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cthrc1Q9D1D6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cthrc1Q9D1D6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cthrc1Q9D1D6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cthrc1Q9D1D6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cthrc1Q9D1D6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cthrc1Q9D1D6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cthrc1Q9D1D6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cthrc1Q9D1D6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cthrc1Q9D1D6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Cthrc1Q9D1D6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cthrc1Q9D1D6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cthrc1Q9D1D6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cthrc1Q9D1D6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cthrc1Q9D1D6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cthrc1Q9D1D6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cthrc1Q9D1D6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cthrc1Q9D1D6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cthrc1Q9D1D6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cthrc1Q9D1D6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cthrc1Q9D1D6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Cthrc1Q9D1D6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cthrc1Q9D1D6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cthrc1Q9D1D6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cthrc1Q9D1D6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cthrc1Q9D1D6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cthrc1Q9D1D6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cthrc1Q9D1D6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cthrc1Q9D1D6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cthrc1Q9D1D6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cthrc1Q9D1D6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cthrc1Q9D1D6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cthrc1Q9D1D6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cthrc1Q9D1D6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cthrc1Q9D1D6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cthrc1Q9D1D6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cthrc1Q9D1D6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cthrc1Q9D1D6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cthrc1Q9D1D6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms