Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0I4

Stx17, Syntaxin-17, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx17Q9D0I4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Stx17Q9D0I4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Stx17Q9D0I4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Stx17Q9D0I4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Stx17Q9D0I4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Stx17Q9D0I4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Stx17Q9D0I4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Stx17Q9D0I4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Stx17Q9D0I4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Stx17Q9D0I4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Stx17Q9D0I4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Stx17Q9D0I4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Stx17Q9D0I4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Stx17Q9D0I4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Stx17Q9D0I4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Stx17Q9D0I4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Stx17Q9D0I4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Stx17Q9D0I4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Stx17Q9D0I4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Stx17Q9D0I4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Stx17Q9D0I4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Stx17Q9D0I4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Stx17Q9D0I4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Stx17Q9D0I4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Stx17Q9D0I4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Stx17Q9D0I4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Stx17Q9D0I4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Stx17Q9D0I4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Stx17Q9D0I4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Stx17Q9D0I4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Stx17Q9D0I4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Stx17Q9D0I4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Stx17Q9D0I4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Stx17Q9D0I4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Stx17Q9D0I4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Stx17Q9D0I4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Stx17Q9D0I4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Stx17Q9D0I4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Stx17Q9D0I4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Stx17Q9D0I4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Stx17Q9D0I4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Stx17Q9D0I4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Stx17Q9D0I4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Stx17Q9D0I4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Stx17Q9D0I4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Stx17Q9D0I4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Stx17Q9D0I4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Stx17Q9D0I4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Stx17Q9D0I4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Stx17Q9D0I4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Stx17Q9D0I4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Stx17Q9D0I4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Stx17Q9D0I4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Stx17Q9D0I4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Stx17Q9D0I4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Stx17Q9D0I4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Stx17Q9D0I4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Stx17Q9D0I4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Stx17Q9D0I4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Stx17Q9D0I4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Stx17Q9D0I4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Stx17Q9D0I4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Stx17Q9D0I4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Stx17Q9D0I4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Stx17Q9D0I4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Stx17Q9D0I4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Stx17Q9D0I4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Stx17Q9D0I4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Stx17Q9D0I4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Stx17Q9D0I4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Stx17Q9D0I4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Stx17Q9D0I4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Stx17Q9D0I4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Stx17Q9D0I4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Stx17Q9D0I4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Stx17Q9D0I4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Stx17Q9D0I4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Stx17Q9D0I4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Stx17Q9D0I4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Stx17Q9D0I4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Stx17Q9D0I4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Stx17Q9D0I4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Stx17Q9D0I4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Stx17Q9D0I4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Stx17Q9D0I4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Stx17Q9D0I4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Stx17Q9D0I4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Stx17Q9D0I4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Stx17Q9D0I4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Stx17Q9D0I4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Stx17Q9D0I4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Stx17Q9D0I4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Stx17Q9D0I4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Stx17Q9D0I4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Stx17Q9D0I4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Stx17Q9D0I4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Stx17Q9D0I4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Stx17Q9D0I4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Stx17Q9D0I4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Stx17Q9D0I4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms