Protein–RNA interactions for Protein: Q9D071

Mms19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mms19Q9D071 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Mms19Q9D071 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Mms19Q9D071 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Mms19Q9D071 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Mms19Q9D071 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Mms19Q9D071 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Mms19Q9D071 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Mms19Q9D071 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Mms19Q9D071 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Mms19Q9D071 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Mms19Q9D071 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Mms19Q9D071 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Mms19Q9D071 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Mms19Q9D071 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Mms19Q9D071 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Mms19Q9D071 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Mms19Q9D071 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Mms19Q9D071 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Mms19Q9D071 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Mms19Q9D071 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Mms19Q9D071 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Mms19Q9D071 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Mms19Q9D071 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Mms19Q9D071 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Mms19Q9D071 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Mms19Q9D071 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Mms19Q9D071 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Mms19Q9D071 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Mms19Q9D071 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Mms19Q9D071 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Mms19Q9D071 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Mms19Q9D071 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Mms19Q9D071 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Mms19Q9D071 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Mms19Q9D071 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Mms19Q9D071 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Mms19Q9D071 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Mms19Q9D071 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Mms19Q9D071 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Mms19Q9D071 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Mms19Q9D071 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Mms19Q9D071 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Mms19Q9D071 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Mms19Q9D071 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Mms19Q9D071 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Mms19Q9D071 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mms19Q9D071 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mms19Q9D071 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mms19Q9D071 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mms19Q9D071 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mms19Q9D071 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mms19Q9D071 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mms19Q9D071 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Mms19Q9D071 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mms19Q9D071 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Mms19Q9D071 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mms19Q9D071 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mms19Q9D071 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Mms19Q9D071 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mms19Q9D071 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mms19Q9D071 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mms19Q9D071 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mms19Q9D071 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mms19Q9D071 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mms19Q9D071 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Mms19Q9D071 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mms19Q9D071 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
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Mms19Q9D071 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mms19Q9D071 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mms19Q9D071 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Mms19Q9D071 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mms19Q9D071 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mms19Q9D071 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mms19Q9D071 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mms19Q9D071 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mms19Q9D071 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mms19Q9D071 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mms19Q9D071 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Mms19Q9D071 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mms19Q9D071 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mms19Q9D071 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mms19Q9D071 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mms19Q9D071 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mms19Q9D071 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mms19Q9D071 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Mms19Q9D071 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mms19Q9D071 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mms19Q9D071 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mms19Q9D071 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mms19Q9D071 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mms19Q9D071 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Mms19Q9D071 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Mms19Q9D071 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Mms19Q9D071 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Mms19Q9D071 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mms19Q9D071 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mms19Q9D071 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Mms19Q9D071 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Mms19Q9D071 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms