Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYZ2

Tpd52l2, Tumor protein D54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpd52l2Q9CYZ2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tpd52l2Q9CYZ2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tpd52l2Q9CYZ2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tpd52l2Q9CYZ2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tpd52l2Q9CYZ2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Tpd52l2Q9CYZ2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tpd52l2Q9CYZ2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tpd52l2Q9CYZ2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tpd52l2Q9CYZ2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tpd52l2Q9CYZ2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tpd52l2Q9CYZ2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tpd52l2Q9CYZ2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Tpd52l2Q9CYZ2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tpd52l2Q9CYZ2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tpd52l2Q9CYZ2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tpd52l2Q9CYZ2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tpd52l2Q9CYZ2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tpd52l2Q9CYZ2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Tpd52l2Q9CYZ2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tpd52l2Q9CYZ2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tpd52l2Q9CYZ2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tpd52l2Q9CYZ2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tpd52l2Q9CYZ2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tpd52l2Q9CYZ2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tpd52l2Q9CYZ2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tpd52l2Q9CYZ2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Tpd52l2Q9CYZ2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tpd52l2Q9CYZ2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tpd52l2Q9CYZ2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tpd52l2Q9CYZ2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tpd52l2Q9CYZ2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tpd52l2Q9CYZ2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Tpd52l2Q9CYZ2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tpd52l2Q9CYZ2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tpd52l2Q9CYZ2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tpd52l2Q9CYZ2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tpd52l2Q9CYZ2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tpd52l2Q9CYZ2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tpd52l2Q9CYZ2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tpd52l2Q9CYZ2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tpd52l2Q9CYZ2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tpd52l2Q9CYZ2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tpd52l2Q9CYZ2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Tpd52l2Q9CYZ2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tpd52l2Q9CYZ2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tpd52l2Q9CYZ2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tpd52l2Q9CYZ2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tpd52l2Q9CYZ2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Tpd52l2Q9CYZ2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Tpd52l2Q9CYZ2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tpd52l2Q9CYZ2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tpd52l2Q9CYZ2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tpd52l2Q9CYZ2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tpd52l2Q9CYZ2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tpd52l2Q9CYZ2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tpd52l2Q9CYZ2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tpd52l2Q9CYZ2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tpd52l2Q9CYZ2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tpd52l2Q9CYZ2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Tpd52l2Q9CYZ2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tpd52l2Q9CYZ2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tpd52l2Q9CYZ2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tpd52l2Q9CYZ2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tpd52l2Q9CYZ2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tpd52l2Q9CYZ2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tpd52l2Q9CYZ2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tpd52l2Q9CYZ2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tpd52l2Q9CYZ2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tpd52l2Q9CYZ2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tpd52l2Q9CYZ2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tpd52l2Q9CYZ2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tpd52l2Q9CYZ2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tpd52l2Q9CYZ2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tpd52l2Q9CYZ2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tpd52l2Q9CYZ2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tpd52l2Q9CYZ2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Tpd52l2Q9CYZ2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tpd52l2Q9CYZ2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Tpd52l2Q9CYZ2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tpd52l2Q9CYZ2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tpd52l2Q9CYZ2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tpd52l2Q9CYZ2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tpd52l2Q9CYZ2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tpd52l2Q9CYZ2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tpd52l2Q9CYZ2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tpd52l2Q9CYZ2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tpd52l2Q9CYZ2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tpd52l2Q9CYZ2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tpd52l2Q9CYZ2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tpd52l2Q9CYZ2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Tpd52l2Q9CYZ2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tpd52l2Q9CYZ2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tpd52l2Q9CYZ2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tpd52l2Q9CYZ2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tpd52l2Q9CYZ2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tpd52l2Q9CYZ2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tpd52l2Q9CYZ2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tpd52l2Q9CYZ2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Tpd52l2Q9CYZ2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tpd52l2Q9CYZ2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms