Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYW4

Hdhd3, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdhd3Q9CYW4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hdhd3Q9CYW4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hdhd3Q9CYW4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Hdhd3Q9CYW4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hdhd3Q9CYW4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hdhd3Q9CYW4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hdhd3Q9CYW4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hdhd3Q9CYW4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hdhd3Q9CYW4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hdhd3Q9CYW4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hdhd3Q9CYW4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hdhd3Q9CYW4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hdhd3Q9CYW4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hdhd3Q9CYW4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hdhd3Q9CYW4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hdhd3Q9CYW4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hdhd3Q9CYW4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hdhd3Q9CYW4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hdhd3Q9CYW4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hdhd3Q9CYW4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hdhd3Q9CYW4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hdhd3Q9CYW4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hdhd3Q9CYW4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hdhd3Q9CYW4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hdhd3Q9CYW4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hdhd3Q9CYW4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hdhd3Q9CYW4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hdhd3Q9CYW4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hdhd3Q9CYW4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hdhd3Q9CYW4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hdhd3Q9CYW4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hdhd3Q9CYW4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hdhd3Q9CYW4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Hdhd3Q9CYW4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hdhd3Q9CYW4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hdhd3Q9CYW4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hdhd3Q9CYW4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hdhd3Q9CYW4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hdhd3Q9CYW4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hdhd3Q9CYW4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hdhd3Q9CYW4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hdhd3Q9CYW4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hdhd3Q9CYW4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hdhd3Q9CYW4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hdhd3Q9CYW4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hdhd3Q9CYW4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hdhd3Q9CYW4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hdhd3Q9CYW4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hdhd3Q9CYW4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hdhd3Q9CYW4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hdhd3Q9CYW4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hdhd3Q9CYW4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hdhd3Q9CYW4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hdhd3Q9CYW4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hdhd3Q9CYW4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hdhd3Q9CYW4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hdhd3Q9CYW4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hdhd3Q9CYW4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Hdhd3Q9CYW4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hdhd3Q9CYW4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hdhd3Q9CYW4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Hdhd3Q9CYW4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hdhd3Q9CYW4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hdhd3Q9CYW4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hdhd3Q9CYW4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hdhd3Q9CYW4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hdhd3Q9CYW4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hdhd3Q9CYW4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hdhd3Q9CYW4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hdhd3Q9CYW4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hdhd3Q9CYW4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hdhd3Q9CYW4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hdhd3Q9CYW4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hdhd3Q9CYW4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hdhd3Q9CYW4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hdhd3Q9CYW4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hdhd3Q9CYW4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hdhd3Q9CYW4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hdhd3Q9CYW4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hdhd3Q9CYW4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hdhd3Q9CYW4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hdhd3Q9CYW4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hdhd3Q9CYW4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hdhd3Q9CYW4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hdhd3Q9CYW4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hdhd3Q9CYW4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hdhd3Q9CYW4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hdhd3Q9CYW4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hdhd3Q9CYW4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hdhd3Q9CYW4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hdhd3Q9CYW4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hdhd3Q9CYW4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hdhd3Q9CYW4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hdhd3Q9CYW4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hdhd3Q9CYW4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hdhd3Q9CYW4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hdhd3Q9CYW4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hdhd3Q9CYW4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hdhd3Q9CYW4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hdhd3Q9CYW4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.8 ms