Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY50

Ssr1, Translocon-associated protein subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssr1Q9CY50 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ssr1Q9CY50 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ssr1Q9CY50 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ssr1Q9CY50 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ssr1Q9CY50 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ssr1Q9CY50 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ssr1Q9CY50 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ssr1Q9CY50 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ssr1Q9CY50 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ssr1Q9CY50 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ssr1Q9CY50 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ssr1Q9CY50 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ssr1Q9CY50 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ssr1Q9CY50 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ssr1Q9CY50 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ssr1Q9CY50 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ssr1Q9CY50 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ssr1Q9CY50 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ssr1Q9CY50 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ssr1Q9CY50 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ssr1Q9CY50 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ssr1Q9CY50 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ssr1Q9CY50 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ssr1Q9CY50 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ssr1Q9CY50 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ssr1Q9CY50 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ssr1Q9CY50 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ssr1Q9CY50 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ssr1Q9CY50 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ssr1Q9CY50 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ssr1Q9CY50 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ssr1Q9CY50 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ssr1Q9CY50 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ssr1Q9CY50 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ssr1Q9CY50 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ssr1Q9CY50 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ssr1Q9CY50 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ssr1Q9CY50 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ssr1Q9CY50 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ssr1Q9CY50 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ssr1Q9CY50 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ssr1Q9CY50 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ssr1Q9CY50 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ssr1Q9CY50 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ssr1Q9CY50 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ssr1Q9CY50 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ssr1Q9CY50 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ssr1Q9CY50 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ssr1Q9CY50 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ssr1Q9CY50 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ssr1Q9CY50 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ssr1Q9CY50 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ssr1Q9CY50 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ssr1Q9CY50 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ssr1Q9CY50 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Ssr1Q9CY50 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Ssr1Q9CY50 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ssr1Q9CY50 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ssr1Q9CY50 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ssr1Q9CY50 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ssr1Q9CY50 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ssr1Q9CY50 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ssr1Q9CY50 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ssr1Q9CY50 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ssr1Q9CY50 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ssr1Q9CY50 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ssr1Q9CY50 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ssr1Q9CY50 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ssr1Q9CY50 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ssr1Q9CY50 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ssr1Q9CY50 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ssr1Q9CY50 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ssr1Q9CY50 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ssr1Q9CY50 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ssr1Q9CY50 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ssr1Q9CY50 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ssr1Q9CY50 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ssr1Q9CY50 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ssr1Q9CY50 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ssr1Q9CY50 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ssr1Q9CY50 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ssr1Q9CY50 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ssr1Q9CY50 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ssr1Q9CY50 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ssr1Q9CY50 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ssr1Q9CY50 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ssr1Q9CY50 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ssr1Q9CY50 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ssr1Q9CY50 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ssr1Q9CY50 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ssr1Q9CY50 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ssr1Q9CY50 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ssr1Q9CY50 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ssr1Q9CY50 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ssr1Q9CY50 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ssr1Q9CY50 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ssr1Q9CY50 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ssr1Q9CY50 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Ssr1Q9CY50 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ssr1Q9CY50 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms