Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmed5Q9CXE7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmed5Q9CXE7 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmed5Q9CXE7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmed5Q9CXE7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmed5Q9CXE7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmed5Q9CXE7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmed5Q9CXE7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmed5Q9CXE7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmed5Q9CXE7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmed5Q9CXE7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmed5Q9CXE7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmed5Q9CXE7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmed5Q9CXE7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmed5Q9CXE7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmed5Q9CXE7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmed5Q9CXE7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmed5Q9CXE7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmed5Q9CXE7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmed5Q9CXE7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmed5Q9CXE7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmed5Q9CXE7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmed5Q9CXE7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmed5Q9CXE7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmed5Q9CXE7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmed5Q9CXE7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmed5Q9CXE7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmed5Q9CXE7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmed5Q9CXE7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmed5Q9CXE7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmed5Q9CXE7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmed5Q9CXE7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmed5Q9CXE7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmed5Q9CXE7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmed5Q9CXE7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmed5Q9CXE7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmed5Q9CXE7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmed5Q9CXE7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmed5Q9CXE7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmed5Q9CXE7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmed5Q9CXE7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmed5Q9CXE7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmed5Q9CXE7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmed5Q9CXE7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmed5Q9CXE7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmed5Q9CXE7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmed5Q9CXE7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmed5Q9CXE7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmed5Q9CXE7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmed5Q9CXE7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmed5Q9CXE7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmed5Q9CXE7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmed5Q9CXE7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmed5Q9CXE7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmed5Q9CXE7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmed5Q9CXE7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmed5Q9CXE7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmed5Q9CXE7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmed5Q9CXE7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmed5Q9CXE7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmed5Q9CXE7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmed5Q9CXE7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmed5Q9CXE7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmed5Q9CXE7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmed5Q9CXE7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmed5Q9CXE7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmed5Q9CXE7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmed5Q9CXE7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmed5Q9CXE7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmed5Q9CXE7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmed5Q9CXE7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmed5Q9CXE7 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmed5Q9CXE7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmed5Q9CXE7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmed5Q9CXE7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmed5Q9CXE7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmed5Q9CXE7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmed5Q9CXE7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmed5Q9CXE7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmed5Q9CXE7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmed5Q9CXE7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmed5Q9CXE7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmed5Q9CXE7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmed5Q9CXE7 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmed5Q9CXE7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmed5Q9CXE7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmed5Q9CXE7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmed5Q9CXE7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmed5Q9CXE7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmed5Q9CXE7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmed5Q9CXE7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmed5Q9CXE7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmed5Q9CXE7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmed5Q9CXE7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmed5Q9CXE7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmed5Q9CXE7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmed5Q9CXE7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmed5Q9CXE7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmed5Q9CXE7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmed5Q9CXE7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms