Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX30

Yif1b, Protein YIF1B, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yif1bQ9CX30 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Yif1bQ9CX30 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Yif1bQ9CX30 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Yif1bQ9CX30 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Yif1bQ9CX30 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Yif1bQ9CX30 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Yif1bQ9CX30 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Yif1bQ9CX30 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Yif1bQ9CX30 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Yif1bQ9CX30 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Yif1bQ9CX30 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Yif1bQ9CX30 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Yif1bQ9CX30 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Yif1bQ9CX30 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Yif1bQ9CX30 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Yif1bQ9CX30 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Yif1bQ9CX30 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Yif1bQ9CX30 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Yif1bQ9CX30 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Yif1bQ9CX30 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Yif1bQ9CX30 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Yif1bQ9CX30 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Yif1bQ9CX30 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Yif1bQ9CX30 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Yif1bQ9CX30 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Yif1bQ9CX30 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Yif1bQ9CX30 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Yif1bQ9CX30 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Yif1bQ9CX30 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Yif1bQ9CX30 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Yif1bQ9CX30 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Yif1bQ9CX30 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Yif1bQ9CX30 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Yif1bQ9CX30 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Yif1bQ9CX30 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Yif1bQ9CX30 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Yif1bQ9CX30 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Yif1bQ9CX30 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Yif1bQ9CX30 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Yif1bQ9CX30 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Yif1bQ9CX30 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Yif1bQ9CX30 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Yif1bQ9CX30 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Yif1bQ9CX30 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Yif1bQ9CX30 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Yif1bQ9CX30 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Yif1bQ9CX30 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Yif1bQ9CX30 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Yif1bQ9CX30 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Yif1bQ9CX30 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Yif1bQ9CX30 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Yif1bQ9CX30 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Yif1bQ9CX30 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Yif1bQ9CX30 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Yif1bQ9CX30 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Yif1bQ9CX30 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Yif1bQ9CX30 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Yif1bQ9CX30 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Yif1bQ9CX30 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Yif1bQ9CX30 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Yif1bQ9CX30 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Yif1bQ9CX30 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Yif1bQ9CX30 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Yif1bQ9CX30 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Yif1bQ9CX30 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Yif1bQ9CX30 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Yif1bQ9CX30 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Yif1bQ9CX30 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Yif1bQ9CX30 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Yif1bQ9CX30 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Yif1bQ9CX30 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Yif1bQ9CX30 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Yif1bQ9CX30 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Yif1bQ9CX30 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Yif1bQ9CX30 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Yif1bQ9CX30 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Yif1bQ9CX30 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Yif1bQ9CX30 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Yif1bQ9CX30 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Yif1bQ9CX30 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Yif1bQ9CX30 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Yif1bQ9CX30 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Yif1bQ9CX30 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Yif1bQ9CX30 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Yif1bQ9CX30 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Yif1bQ9CX30 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Yif1bQ9CX30 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Yif1bQ9CX30 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Yif1bQ9CX30 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Yif1bQ9CX30 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Yif1bQ9CX30 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Yif1bQ9CX30 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Yif1bQ9CX30 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Yif1bQ9CX30 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Yif1bQ9CX30 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Yif1bQ9CX30 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Yif1bQ9CX30 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Yif1bQ9CX30 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Yif1bQ9CX30 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Yif1bQ9CX30 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms