Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY3

Setd6, N-lysine methyltransferase SETD6, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd6Q9CWY3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Setd6Q9CWY3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Setd6Q9CWY3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Setd6Q9CWY3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Setd6Q9CWY3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Setd6Q9CWY3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Setd6Q9CWY3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Setd6Q9CWY3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Setd6Q9CWY3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Setd6Q9CWY3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Setd6Q9CWY3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Setd6Q9CWY3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Setd6Q9CWY3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Setd6Q9CWY3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Setd6Q9CWY3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Setd6Q9CWY3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Setd6Q9CWY3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Setd6Q9CWY3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Setd6Q9CWY3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Setd6Q9CWY3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Setd6Q9CWY3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Setd6Q9CWY3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Setd6Q9CWY3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Setd6Q9CWY3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Setd6Q9CWY3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Setd6Q9CWY3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Setd6Q9CWY3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Setd6Q9CWY3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Setd6Q9CWY3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Setd6Q9CWY3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Setd6Q9CWY3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Setd6Q9CWY3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Setd6Q9CWY3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Setd6Q9CWY3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Setd6Q9CWY3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Setd6Q9CWY3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Setd6Q9CWY3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Setd6Q9CWY3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Setd6Q9CWY3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Setd6Q9CWY3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Setd6Q9CWY3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Setd6Q9CWY3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Setd6Q9CWY3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Setd6Q9CWY3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Setd6Q9CWY3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Setd6Q9CWY3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Setd6Q9CWY3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Setd6Q9CWY3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Setd6Q9CWY3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Setd6Q9CWY3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Setd6Q9CWY3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Setd6Q9CWY3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Setd6Q9CWY3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Setd6Q9CWY3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Setd6Q9CWY3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Setd6Q9CWY3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Setd6Q9CWY3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Setd6Q9CWY3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Setd6Q9CWY3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Setd6Q9CWY3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Setd6Q9CWY3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Setd6Q9CWY3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Setd6Q9CWY3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Setd6Q9CWY3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Setd6Q9CWY3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Setd6Q9CWY3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Setd6Q9CWY3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Setd6Q9CWY3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Setd6Q9CWY3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Setd6Q9CWY3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Setd6Q9CWY3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Setd6Q9CWY3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Setd6Q9CWY3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Setd6Q9CWY3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Setd6Q9CWY3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Setd6Q9CWY3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Setd6Q9CWY3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Setd6Q9CWY3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Setd6Q9CWY3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Setd6Q9CWY3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Setd6Q9CWY3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Setd6Q9CWY3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Setd6Q9CWY3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Setd6Q9CWY3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Setd6Q9CWY3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Setd6Q9CWY3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Setd6Q9CWY3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Setd6Q9CWY3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Setd6Q9CWY3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Setd6Q9CWY3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Setd6Q9CWY3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Setd6Q9CWY3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Setd6Q9CWY3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Setd6Q9CWY3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Setd6Q9CWY3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Setd6Q9CWY3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Setd6Q9CWY3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Setd6Q9CWY3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Setd6Q9CWY3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Setd6Q9CWY3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms