Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUU3

Sycp2, Synaptonemal complex protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2Q9CUU3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC44.75■■■■■ 4.76
Sycp2Q9CUU3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.75■■■■■ 4.75
Sycp2Q9CUU3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.75■■■■■ 4.75
Sycp2Q9CUU3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC44.73■■■■■ 4.75
Sycp2Q9CUU3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC44.73■■■■■ 4.75
Sycp2Q9CUU3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC44.73■■■■■ 4.75
Sycp2Q9CUU3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.73■■■■■ 4.75
Sycp2Q9CUU3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC44.72■■■■■ 4.75
Sycp2Q9CUU3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.72■■■■■ 4.75
Sycp2Q9CUU3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.72■■■■■ 4.75
Sycp2Q9CUU3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.72■■■■■ 4.75
Sycp2Q9CUU3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC44.71■■■■■ 4.75
Sycp2Q9CUU3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC44.69■■■■■ 4.74
Sycp2Q9CUU3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC44.69■■■■■ 4.74
Sycp2Q9CUU3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC44.68■■■■■ 4.74
Sycp2Q9CUU3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC44.67■■■■■ 4.74
Sycp2Q9CUU3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC44.67■■■■■ 4.74
Sycp2Q9CUU3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC44.66■■■■■ 4.74
Sycp2Q9CUU3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC44.66■■■■■ 4.74
Sycp2Q9CUU3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.64■■■■■ 4.74
Sycp2Q9CUU3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC44.64■■■■■ 4.74
Sycp2Q9CUU3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.63■■■■■ 4.74
Sycp2Q9CUU3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC44.63■■■■■ 4.73
Sycp2Q9CUU3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC44.63■■■■■ 4.73
Sycp2Q9CUU3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.61■■■■■ 4.73
Sycp2Q9CUU3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.61■■■■■ 4.73
Sycp2Q9CUU3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.6■■■■■ 4.73
Sycp2Q9CUU3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.6■■■■■ 4.73
Sycp2Q9CUU3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC44.6■■■■■ 4.73
Sycp2Q9CUU3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC44.6■■■■■ 4.73
Sycp2Q9CUU3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.59■■■■■ 4.73
Sycp2Q9CUU3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC44.59■■■■■ 4.73
Sycp2Q9CUU3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.59■■■■■ 4.73
Sycp2Q9CUU3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.59■■■■■ 4.73
Sycp2Q9CUU3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC44.59■■■■■ 4.73
Sycp2Q9CUU3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.58■■■■■ 4.73
Sycp2Q9CUU3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC44.57■■■■■ 4.73
Sycp2Q9CUU3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC44.57■■■■■ 4.73
Sycp2Q9CUU3 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.57■■■■■ 4.73
Sycp2Q9CUU3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.56■■■■■ 4.72
Sycp2Q9CUU3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.55■■■■■ 4.72
Sycp2Q9CUU3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC44.55■■■■■ 4.72
Sycp2Q9CUU3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC44.53■■■■■ 4.72
Sycp2Q9CUU3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC44.53■■■■■ 4.72
Sycp2Q9CUU3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.52■■■■■ 4.72
Sycp2Q9CUU3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC44.5■■■■■ 4.71
Sycp2Q9CUU3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC44.5■■■■■ 4.71
Sycp2Q9CUU3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.49■■■■■ 4.71
Sycp2Q9CUU3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC44.49■■■■■ 4.71
Sycp2Q9CUU3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC44.47■■■■■ 4.71
Sycp2Q9CUU3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC44.47■■■■■ 4.71
Sycp2Q9CUU3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC44.47■■■■■ 4.71
Sycp2Q9CUU3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC44.45■■■■■ 4.71
Sycp2Q9CUU3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.45■■■■■ 4.71
Sycp2Q9CUU3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.45■■■■■ 4.71
Sycp2Q9CUU3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.44■■■■■ 4.7
Sycp2Q9CUU3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.42■■■■■ 4.7
Sycp2Q9CUU3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC44.42■■■■■ 4.7
Sycp2Q9CUU3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC44.41■■■■■ 4.7
Sycp2Q9CUU3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC44.41■■■■■ 4.7
Sycp2Q9CUU3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC44.41■■■■■ 4.7
Sycp2Q9CUU3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC44.4■■■■■ 4.7
Sycp2Q9CUU3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC44.4■■■■■ 4.7
Sycp2Q9CUU3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC44.4■■■■■ 4.7
Sycp2Q9CUU3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.39■■■■■ 4.7
Sycp2Q9CUU3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC44.38■■■■■ 4.7
Sycp2Q9CUU3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.38■■■■■ 4.7
Sycp2Q9CUU3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.38■■■■■ 4.7
Sycp2Q9CUU3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC44.38■■■■■ 4.69
Sycp2Q9CUU3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC44.37■■■■■ 4.69
Sycp2Q9CUU3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.37■■■■■ 4.69
Sycp2Q9CUU3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.36■■■■■ 4.69
Sycp2Q9CUU3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.36■■■■■ 4.69
Sycp2Q9CUU3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC44.35■■■■■ 4.69
Sycp2Q9CUU3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.34■■■■■ 4.69
Sycp2Q9CUU3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC44.34■■■■■ 4.69
Sycp2Q9CUU3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.34■■■■■ 4.69
Sycp2Q9CUU3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.33■■■■■ 4.69
Sycp2Q9CUU3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC44.32■■■■■ 4.69
Sycp2Q9CUU3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.31■■■■■ 4.68
Sycp2Q9CUU3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.31■■■■■ 4.68
Sycp2Q9CUU3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.3■■■■■ 4.68
Sycp2Q9CUU3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC44.29■■■■■ 4.68
Sycp2Q9CUU3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC44.29■■■■■ 4.68
Sycp2Q9CUU3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC44.29■■■■■ 4.68
Sycp2Q9CUU3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC44.29■■■■■ 4.68
Sycp2Q9CUU3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.28■■■■■ 4.68
Sycp2Q9CUU3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC44.28■■■■■ 4.68
Sycp2Q9CUU3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC44.28■■■■■ 4.68
Sycp2Q9CUU3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC44.26■■■■■ 4.68
Sycp2Q9CUU3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC44.25■■■■■ 4.67
Sycp2Q9CUU3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.25■■■■■ 4.67
Sycp2Q9CUU3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.24■■■■■ 4.67
Sycp2Q9CUU3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.23■■■■■ 4.67
Sycp2Q9CUU3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC44.23■■■■■ 4.67
Sycp2Q9CUU3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.22■■■■■ 4.67
Sycp2Q9CUU3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC44.21■■■■■ 4.67
Sycp2Q9CUU3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.21■■■■■ 4.67
Sycp2Q9CUU3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.2■■■■■ 4.67
Sycp2Q9CUU3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.2■■■■■ 4.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms