Protein–RNA interactions for Protein: Q9CU62

Smc1a, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc1aQ9CU62 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Smc1aQ9CU62 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Smc1aQ9CU62 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Smc1aQ9CU62 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Smc1aQ9CU62 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Smc1aQ9CU62 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Smc1aQ9CU62 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Smc1aQ9CU62 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Smc1aQ9CU62 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Smc1aQ9CU62 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Smc1aQ9CU62 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Smc1aQ9CU62 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Smc1aQ9CU62 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Smc1aQ9CU62 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Smc1aQ9CU62 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Smc1aQ9CU62 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Smc1aQ9CU62 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Smc1aQ9CU62 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Smc1aQ9CU62 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Smc1aQ9CU62 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Smc1aQ9CU62 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Smc1aQ9CU62 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Smc1aQ9CU62 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Smc1aQ9CU62 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Smc1aQ9CU62 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Smc1aQ9CU62 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Smc1aQ9CU62 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Smc1aQ9CU62 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Smc1aQ9CU62 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Smc1aQ9CU62 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Smc1aQ9CU62 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Smc1aQ9CU62 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Smc1aQ9CU62 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Smc1aQ9CU62 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Smc1aQ9CU62 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Smc1aQ9CU62 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Smc1aQ9CU62 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Smc1aQ9CU62 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Smc1aQ9CU62 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Smc1aQ9CU62 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Smc1aQ9CU62 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Smc1aQ9CU62 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Smc1aQ9CU62 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Smc1aQ9CU62 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Smc1aQ9CU62 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Smc1aQ9CU62 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Smc1aQ9CU62 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Smc1aQ9CU62 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Smc1aQ9CU62 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Smc1aQ9CU62 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Smc1aQ9CU62 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Smc1aQ9CU62 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Smc1aQ9CU62 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Smc1aQ9CU62 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Smc1aQ9CU62 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Smc1aQ9CU62 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Smc1aQ9CU62 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Smc1aQ9CU62 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Smc1aQ9CU62 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Smc1aQ9CU62 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Smc1aQ9CU62 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Smc1aQ9CU62 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Smc1aQ9CU62 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Smc1aQ9CU62 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Smc1aQ9CU62 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Smc1aQ9CU62 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Smc1aQ9CU62 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Smc1aQ9CU62 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Smc1aQ9CU62 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smc1aQ9CU62 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smc1aQ9CU62 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smc1aQ9CU62 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smc1aQ9CU62 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smc1aQ9CU62 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Smc1aQ9CU62 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Smc1aQ9CU62 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Smc1aQ9CU62 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Smc1aQ9CU62 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Smc1aQ9CU62 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Smc1aQ9CU62 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Smc1aQ9CU62 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Smc1aQ9CU62 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Smc1aQ9CU62 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Smc1aQ9CU62 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Smc1aQ9CU62 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Smc1aQ9CU62 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Smc1aQ9CU62 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Smc1aQ9CU62 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Smc1aQ9CU62 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Smc1aQ9CU62 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Smc1aQ9CU62 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Smc1aQ9CU62 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Smc1aQ9CU62 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Smc1aQ9CU62 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Smc1aQ9CU62 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Smc1aQ9CU62 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Smc1aQ9CU62 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Smc1aQ9CU62 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Smc1aQ9CU62 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Smc1aQ9CU62 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms