Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSH3

Dis3, Exosome complex exonuclease RRP44, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 958 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dis3Q9CSH3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Dis3Q9CSH3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Dis3Q9CSH3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Dis3Q9CSH3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Dis3Q9CSH3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Dis3Q9CSH3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Dis3Q9CSH3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Dis3Q9CSH3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Dis3Q9CSH3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Dis3Q9CSH3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Dis3Q9CSH3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Dis3Q9CSH3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Dis3Q9CSH3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Dis3Q9CSH3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Dis3Q9CSH3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Dis3Q9CSH3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Dis3Q9CSH3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Dis3Q9CSH3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Dis3Q9CSH3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Dis3Q9CSH3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Dis3Q9CSH3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Dis3Q9CSH3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Dis3Q9CSH3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Dis3Q9CSH3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Dis3Q9CSH3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Dis3Q9CSH3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Dis3Q9CSH3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Dis3Q9CSH3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Dis3Q9CSH3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Dis3Q9CSH3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Dis3Q9CSH3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Dis3Q9CSH3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Dis3Q9CSH3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Dis3Q9CSH3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Dis3Q9CSH3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Dis3Q9CSH3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Dis3Q9CSH3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Dis3Q9CSH3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Dis3Q9CSH3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Dis3Q9CSH3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Dis3Q9CSH3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Dis3Q9CSH3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Dis3Q9CSH3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Dis3Q9CSH3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Dis3Q9CSH3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Dis3Q9CSH3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Dis3Q9CSH3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Dis3Q9CSH3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Dis3Q9CSH3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Dis3Q9CSH3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Dis3Q9CSH3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Dis3Q9CSH3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Dis3Q9CSH3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Dis3Q9CSH3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Dis3Q9CSH3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Dis3Q9CSH3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Dis3Q9CSH3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Dis3Q9CSH3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Dis3Q9CSH3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Dis3Q9CSH3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Dis3Q9CSH3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Dis3Q9CSH3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Dis3Q9CSH3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Dis3Q9CSH3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Dis3Q9CSH3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Dis3Q9CSH3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Dis3Q9CSH3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Dis3Q9CSH3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Dis3Q9CSH3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Dis3Q9CSH3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Dis3Q9CSH3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Dis3Q9CSH3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Dis3Q9CSH3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Dis3Q9CSH3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Dis3Q9CSH3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Dis3Q9CSH3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Dis3Q9CSH3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Dis3Q9CSH3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Dis3Q9CSH3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Dis3Q9CSH3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Dis3Q9CSH3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Dis3Q9CSH3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Dis3Q9CSH3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Dis3Q9CSH3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Dis3Q9CSH3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Dis3Q9CSH3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Dis3Q9CSH3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Dis3Q9CSH3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Dis3Q9CSH3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Dis3Q9CSH3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Dis3Q9CSH3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Dis3Q9CSH3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Dis3Q9CSH3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Dis3Q9CSH3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Dis3Q9CSH3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Dis3Q9CSH3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Dis3Q9CSH3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Dis3Q9CSH3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Dis3Q9CSH3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Dis3Q9CSH3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms