Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRB4

1700029F12Rik, RIKEN cDNA 1700029F12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029F12RikQ9CRB4 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
1700029F12RikQ9CRB4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
1700029F12RikQ9CRB4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
1700029F12RikQ9CRB4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
1700029F12RikQ9CRB4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
1700029F12RikQ9CRB4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
1700029F12RikQ9CRB4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
1700029F12RikQ9CRB4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
1700029F12RikQ9CRB4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
1700029F12RikQ9CRB4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
1700029F12RikQ9CRB4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
1700029F12RikQ9CRB4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
1700029F12RikQ9CRB4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
1700029F12RikQ9CRB4 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
1700029F12RikQ9CRB4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
1700029F12RikQ9CRB4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
1700029F12RikQ9CRB4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
1700029F12RikQ9CRB4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
1700029F12RikQ9CRB4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
1700029F12RikQ9CRB4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
1700029F12RikQ9CRB4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
1700029F12RikQ9CRB4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
1700029F12RikQ9CRB4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
1700029F12RikQ9CRB4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
1700029F12RikQ9CRB4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
1700029F12RikQ9CRB4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
1700029F12RikQ9CRB4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
1700029F12RikQ9CRB4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
1700029F12RikQ9CRB4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
1700029F12RikQ9CRB4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
1700029F12RikQ9CRB4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
1700029F12RikQ9CRB4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
1700029F12RikQ9CRB4 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
1700029F12RikQ9CRB4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
1700029F12RikQ9CRB4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
1700029F12RikQ9CRB4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
1700029F12RikQ9CRB4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
1700029F12RikQ9CRB4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
1700029F12RikQ9CRB4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
1700029F12RikQ9CRB4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
1700029F12RikQ9CRB4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
1700029F12RikQ9CRB4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
1700029F12RikQ9CRB4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
1700029F12RikQ9CRB4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
1700029F12RikQ9CRB4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
1700029F12RikQ9CRB4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
1700029F12RikQ9CRB4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
1700029F12RikQ9CRB4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
1700029F12RikQ9CRB4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
1700029F12RikQ9CRB4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
1700029F12RikQ9CRB4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
1700029F12RikQ9CRB4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
1700029F12RikQ9CRB4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
1700029F12RikQ9CRB4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
1700029F12RikQ9CRB4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
1700029F12RikQ9CRB4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
1700029F12RikQ9CRB4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
1700029F12RikQ9CRB4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
1700029F12RikQ9CRB4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
1700029F12RikQ9CRB4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
1700029F12RikQ9CRB4 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
1700029F12RikQ9CRB4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
1700029F12RikQ9CRB4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
1700029F12RikQ9CRB4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
1700029F12RikQ9CRB4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
1700029F12RikQ9CRB4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
1700029F12RikQ9CRB4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
1700029F12RikQ9CRB4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
1700029F12RikQ9CRB4 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
1700029F12RikQ9CRB4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
1700029F12RikQ9CRB4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
1700029F12RikQ9CRB4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
1700029F12RikQ9CRB4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
1700029F12RikQ9CRB4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
1700029F12RikQ9CRB4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
1700029F12RikQ9CRB4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
1700029F12RikQ9CRB4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
1700029F12RikQ9CRB4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
1700029F12RikQ9CRB4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
1700029F12RikQ9CRB4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
1700029F12RikQ9CRB4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
1700029F12RikQ9CRB4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
1700029F12RikQ9CRB4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
1700029F12RikQ9CRB4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
1700029F12RikQ9CRB4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
1700029F12RikQ9CRB4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
1700029F12RikQ9CRB4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
1700029F12RikQ9CRB4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
1700029F12RikQ9CRB4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
1700029F12RikQ9CRB4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
1700029F12RikQ9CRB4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
1700029F12RikQ9CRB4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
1700029F12RikQ9CRB4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
1700029F12RikQ9CRB4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
1700029F12RikQ9CRB4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
1700029F12RikQ9CRB4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
1700029F12RikQ9CRB4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
1700029F12RikQ9CRB4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
1700029F12RikQ9CRB4 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
1700029F12RikQ9CRB4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms