Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR25

Dph2, 2-(3-amino-3-carboxypropyl)histidine synthase subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dph2Q9CR25 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dph2Q9CR25 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dph2Q9CR25 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dph2Q9CR25 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dph2Q9CR25 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dph2Q9CR25 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dph2Q9CR25 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dph2Q9CR25 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dph2Q9CR25 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dph2Q9CR25 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dph2Q9CR25 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dph2Q9CR25 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dph2Q9CR25 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dph2Q9CR25 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dph2Q9CR25 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dph2Q9CR25 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dph2Q9CR25 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dph2Q9CR25 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dph2Q9CR25 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dph2Q9CR25 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dph2Q9CR25 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Dph2Q9CR25 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dph2Q9CR25 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dph2Q9CR25 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dph2Q9CR25 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dph2Q9CR25 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dph2Q9CR25 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dph2Q9CR25 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dph2Q9CR25 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dph2Q9CR25 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dph2Q9CR25 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dph2Q9CR25 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dph2Q9CR25 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dph2Q9CR25 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dph2Q9CR25 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dph2Q9CR25 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dph2Q9CR25 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dph2Q9CR25 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dph2Q9CR25 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dph2Q9CR25 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Dph2Q9CR25 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dph2Q9CR25 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dph2Q9CR25 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dph2Q9CR25 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dph2Q9CR25 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dph2Q9CR25 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dph2Q9CR25 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dph2Q9CR25 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dph2Q9CR25 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dph2Q9CR25 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dph2Q9CR25 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dph2Q9CR25 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Dph2Q9CR25 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dph2Q9CR25 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dph2Q9CR25 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dph2Q9CR25 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dph2Q9CR25 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Dph2Q9CR25 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dph2Q9CR25 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dph2Q9CR25 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Dph2Q9CR25 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Dph2Q9CR25 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dph2Q9CR25 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dph2Q9CR25 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Dph2Q9CR25 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Dph2Q9CR25 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dph2Q9CR25 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dph2Q9CR25 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dph2Q9CR25 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dph2Q9CR25 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dph2Q9CR25 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dph2Q9CR25 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dph2Q9CR25 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dph2Q9CR25 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dph2Q9CR25 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dph2Q9CR25 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dph2Q9CR25 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dph2Q9CR25 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dph2Q9CR25 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dph2Q9CR25 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dph2Q9CR25 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Dph2Q9CR25 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dph2Q9CR25 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dph2Q9CR25 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dph2Q9CR25 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dph2Q9CR25 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dph2Q9CR25 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dph2Q9CR25 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Dph2Q9CR25 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dph2Q9CR25 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dph2Q9CR25 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dph2Q9CR25 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dph2Q9CR25 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dph2Q9CR25 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Dph2Q9CR25 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dph2Q9CR25 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dph2Q9CR25 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dph2Q9CR25 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dph2Q9CR25 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dph2Q9CR25 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms