Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQV6

Map1lc3b, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3B, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map1lc3bQ9CQV6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Map1lc3bQ9CQV6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Map1lc3bQ9CQV6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Map1lc3bQ9CQV6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Map1lc3bQ9CQV6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Map1lc3bQ9CQV6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Map1lc3bQ9CQV6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Map1lc3bQ9CQV6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Map1lc3bQ9CQV6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Map1lc3bQ9CQV6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Map1lc3bQ9CQV6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Map1lc3bQ9CQV6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Map1lc3bQ9CQV6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Map1lc3bQ9CQV6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Map1lc3bQ9CQV6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Map1lc3bQ9CQV6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Map1lc3bQ9CQV6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Map1lc3bQ9CQV6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Map1lc3bQ9CQV6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Map1lc3bQ9CQV6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Map1lc3bQ9CQV6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Map1lc3bQ9CQV6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Map1lc3bQ9CQV6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Map1lc3bQ9CQV6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Map1lc3bQ9CQV6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Map1lc3bQ9CQV6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Map1lc3bQ9CQV6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Map1lc3bQ9CQV6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Map1lc3bQ9CQV6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Map1lc3bQ9CQV6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Map1lc3bQ9CQV6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Map1lc3bQ9CQV6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Map1lc3bQ9CQV6 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Map1lc3bQ9CQV6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Map1lc3bQ9CQV6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Map1lc3bQ9CQV6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Map1lc3bQ9CQV6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Map1lc3bQ9CQV6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Map1lc3bQ9CQV6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Map1lc3bQ9CQV6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Map1lc3bQ9CQV6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Map1lc3bQ9CQV6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Map1lc3bQ9CQV6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Map1lc3bQ9CQV6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Map1lc3bQ9CQV6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Map1lc3bQ9CQV6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Map1lc3bQ9CQV6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Map1lc3bQ9CQV6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Map1lc3bQ9CQV6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Map1lc3bQ9CQV6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Map1lc3bQ9CQV6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Map1lc3bQ9CQV6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Map1lc3bQ9CQV6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Map1lc3bQ9CQV6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Map1lc3bQ9CQV6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Map1lc3bQ9CQV6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Map1lc3bQ9CQV6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Map1lc3bQ9CQV6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Map1lc3bQ9CQV6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Map1lc3bQ9CQV6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Map1lc3bQ9CQV6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Map1lc3bQ9CQV6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Map1lc3bQ9CQV6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Map1lc3bQ9CQV6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Map1lc3bQ9CQV6 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Map1lc3bQ9CQV6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Map1lc3bQ9CQV6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Map1lc3bQ9CQV6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Map1lc3bQ9CQV6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Map1lc3bQ9CQV6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Map1lc3bQ9CQV6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Map1lc3bQ9CQV6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Map1lc3bQ9CQV6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Map1lc3bQ9CQV6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Map1lc3bQ9CQV6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Map1lc3bQ9CQV6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Map1lc3bQ9CQV6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Map1lc3bQ9CQV6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Map1lc3bQ9CQV6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Map1lc3bQ9CQV6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Map1lc3bQ9CQV6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Map1lc3bQ9CQV6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Map1lc3bQ9CQV6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Map1lc3bQ9CQV6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Map1lc3bQ9CQV6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Map1lc3bQ9CQV6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Map1lc3bQ9CQV6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Map1lc3bQ9CQV6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Map1lc3bQ9CQV6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Map1lc3bQ9CQV6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Map1lc3bQ9CQV6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Map1lc3bQ9CQV6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Map1lc3bQ9CQV6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Map1lc3bQ9CQV6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Map1lc3bQ9CQV6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Map1lc3bQ9CQV6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Map1lc3bQ9CQV6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Map1lc3bQ9CQV6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Map1lc3bQ9CQV6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Map1lc3bQ9CQV6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms