Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nudt21Q9CQF3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nudt21Q9CQF3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nudt21Q9CQF3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nudt21Q9CQF3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nudt21Q9CQF3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nudt21Q9CQF3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nudt21Q9CQF3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nudt21Q9CQF3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nudt21Q9CQF3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nudt21Q9CQF3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nudt21Q9CQF3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nudt21Q9CQF3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nudt21Q9CQF3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nudt21Q9CQF3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nudt21Q9CQF3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nudt21Q9CQF3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nudt21Q9CQF3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Nudt21Q9CQF3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nudt21Q9CQF3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nudt21Q9CQF3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Nudt21Q9CQF3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Nudt21Q9CQF3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nudt21Q9CQF3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nudt21Q9CQF3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nudt21Q9CQF3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nudt21Q9CQF3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nudt21Q9CQF3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Nudt21Q9CQF3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Nudt21Q9CQF3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nudt21Q9CQF3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nudt21Q9CQF3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Nudt21Q9CQF3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Nudt21Q9CQF3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nudt21Q9CQF3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nudt21Q9CQF3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nudt21Q9CQF3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nudt21Q9CQF3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nudt21Q9CQF3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nudt21Q9CQF3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nudt21Q9CQF3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nudt21Q9CQF3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nudt21Q9CQF3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nudt21Q9CQF3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nudt21Q9CQF3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nudt21Q9CQF3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nudt21Q9CQF3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Nudt21Q9CQF3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nudt21Q9CQF3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nudt21Q9CQF3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nudt21Q9CQF3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nudt21Q9CQF3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nudt21Q9CQF3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nudt21Q9CQF3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nudt21Q9CQF3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nudt21Q9CQF3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Nudt21Q9CQF3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Nudt21Q9CQF3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nudt21Q9CQF3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nudt21Q9CQF3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nudt21Q9CQF3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nudt21Q9CQF3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nudt21Q9CQF3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nudt21Q9CQF3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nudt21Q9CQF3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Nudt21Q9CQF3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nudt21Q9CQF3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nudt21Q9CQF3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nudt21Q9CQF3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nudt21Q9CQF3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nudt21Q9CQF3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nudt21Q9CQF3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nudt21Q9CQF3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nudt21Q9CQF3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nudt21Q9CQF3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nudt21Q9CQF3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nudt21Q9CQF3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nudt21Q9CQF3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nudt21Q9CQF3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nudt21Q9CQF3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Nudt21Q9CQF3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nudt21Q9CQF3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nudt21Q9CQF3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nudt21Q9CQF3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nudt21Q9CQF3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nudt21Q9CQF3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nudt21Q9CQF3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nudt21Q9CQF3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nudt21Q9CQF3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nudt21Q9CQF3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nudt21Q9CQF3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nudt21Q9CQF3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Nudt21Q9CQF3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nudt21Q9CQF3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nudt21Q9CQF3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Nudt21Q9CQF3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nudt21Q9CQF3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nudt21Q9CQF3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nudt21Q9CQF3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nudt21Q9CQF3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90 ms