Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ47

4921530L21Rik, RIKEN cDNA 4921530L21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921530L21RikQ9CQ47 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
4921530L21RikQ9CQ47 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
4921530L21RikQ9CQ47 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
4921530L21RikQ9CQ47 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
4921530L21RikQ9CQ47 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
4921530L21RikQ9CQ47 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
4921530L21RikQ9CQ47 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
4921530L21RikQ9CQ47 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
4921530L21RikQ9CQ47 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
4921530L21RikQ9CQ47 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
4921530L21RikQ9CQ47 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
4921530L21RikQ9CQ47 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
4921530L21RikQ9CQ47 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
4921530L21RikQ9CQ47 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
4921530L21RikQ9CQ47 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
4921530L21RikQ9CQ47 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
4921530L21RikQ9CQ47 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
4921530L21RikQ9CQ47 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
4921530L21RikQ9CQ47 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
4921530L21RikQ9CQ47 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
4921530L21RikQ9CQ47 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
4921530L21RikQ9CQ47 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
4921530L21RikQ9CQ47 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
4921530L21RikQ9CQ47 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
4921530L21RikQ9CQ47 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
4921530L21RikQ9CQ47 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
4921530L21RikQ9CQ47 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
4921530L21RikQ9CQ47 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
4921530L21RikQ9CQ47 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
4921530L21RikQ9CQ47 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
4921530L21RikQ9CQ47 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
4921530L21RikQ9CQ47 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
4921530L21RikQ9CQ47 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
4921530L21RikQ9CQ47 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
4921530L21RikQ9CQ47 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
4921530L21RikQ9CQ47 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
4921530L21RikQ9CQ47 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
4921530L21RikQ9CQ47 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
4921530L21RikQ9CQ47 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
4921530L21RikQ9CQ47 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
4921530L21RikQ9CQ47 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
4921530L21RikQ9CQ47 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
4921530L21RikQ9CQ47 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
4921530L21RikQ9CQ47 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
4921530L21RikQ9CQ47 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
4921530L21RikQ9CQ47 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
4921530L21RikQ9CQ47 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
4921530L21RikQ9CQ47 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
4921530L21RikQ9CQ47 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
4921530L21RikQ9CQ47 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
4921530L21RikQ9CQ47 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
4921530L21RikQ9CQ47 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
4921530L21RikQ9CQ47 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
4921530L21RikQ9CQ47 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
4921530L21RikQ9CQ47 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
4921530L21RikQ9CQ47 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
4921530L21RikQ9CQ47 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
4921530L21RikQ9CQ47 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
4921530L21RikQ9CQ47 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
4921530L21RikQ9CQ47 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
4921530L21RikQ9CQ47 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
4921530L21RikQ9CQ47 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
4921530L21RikQ9CQ47 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
4921530L21RikQ9CQ47 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
4921530L21RikQ9CQ47 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
4921530L21RikQ9CQ47 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
4921530L21RikQ9CQ47 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
4921530L21RikQ9CQ47 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
4921530L21RikQ9CQ47 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
4921530L21RikQ9CQ47 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
4921530L21RikQ9CQ47 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
4921530L21RikQ9CQ47 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
4921530L21RikQ9CQ47 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
4921530L21RikQ9CQ47 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
4921530L21RikQ9CQ47 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
4921530L21RikQ9CQ47 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
4921530L21RikQ9CQ47 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
4921530L21RikQ9CQ47 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
4921530L21RikQ9CQ47 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
4921530L21RikQ9CQ47 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
4921530L21RikQ9CQ47 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
4921530L21RikQ9CQ47 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
4921530L21RikQ9CQ47 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
4921530L21RikQ9CQ47 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
4921530L21RikQ9CQ47 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
4921530L21RikQ9CQ47 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
4921530L21RikQ9CQ47 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
4921530L21RikQ9CQ47 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
4921530L21RikQ9CQ47 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
4921530L21RikQ9CQ47 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
4921530L21RikQ9CQ47 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
4921530L21RikQ9CQ47 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4921530L21RikQ9CQ47 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4921530L21RikQ9CQ47 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
4921530L21RikQ9CQ47 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
4921530L21RikQ9CQ47 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4921530L21RikQ9CQ47 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4921530L21RikQ9CQ47 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4921530L21RikQ9CQ47 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
4921530L21RikQ9CQ47 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms