Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ18

Rnaseh2c, Ribonuclease H2 subunit C, mousemouse

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Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2cQ9CQ18 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rnaseh2cQ9CQ18 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rnaseh2cQ9CQ18 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rnaseh2cQ9CQ18 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rnaseh2cQ9CQ18 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rnaseh2cQ9CQ18 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rnaseh2cQ9CQ18 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rnaseh2cQ9CQ18 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rnaseh2cQ9CQ18 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rnaseh2cQ9CQ18 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rnaseh2cQ9CQ18 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rnaseh2cQ9CQ18 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rnaseh2cQ9CQ18 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnaseh2cQ9CQ18 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnaseh2cQ9CQ18 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnaseh2cQ9CQ18 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
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