Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ11

2010109I03Rik, RIKEN cDNA 2010109I03, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2010109I03RikQ9CQ11 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
2010109I03RikQ9CQ11 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
2010109I03RikQ9CQ11 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
2010109I03RikQ9CQ11 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
2010109I03RikQ9CQ11 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
2010109I03RikQ9CQ11 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
2010109I03RikQ9CQ11 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
2010109I03RikQ9CQ11 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
2010109I03RikQ9CQ11 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
2010109I03RikQ9CQ11 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
2010109I03RikQ9CQ11 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
2010109I03RikQ9CQ11 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
2010109I03RikQ9CQ11 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
2010109I03RikQ9CQ11 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
2010109I03RikQ9CQ11 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
2010109I03RikQ9CQ11 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
2010109I03RikQ9CQ11 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
2010109I03RikQ9CQ11 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
2010109I03RikQ9CQ11 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
2010109I03RikQ9CQ11 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
2010109I03RikQ9CQ11 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
2010109I03RikQ9CQ11 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
2010109I03RikQ9CQ11 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
2010109I03RikQ9CQ11 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
2010109I03RikQ9CQ11 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
2010109I03RikQ9CQ11 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
2010109I03RikQ9CQ11 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
2010109I03RikQ9CQ11 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
2010109I03RikQ9CQ11 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
2010109I03RikQ9CQ11 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
2010109I03RikQ9CQ11 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
2010109I03RikQ9CQ11 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
2010109I03RikQ9CQ11 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
2010109I03RikQ9CQ11 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
2010109I03RikQ9CQ11 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
2010109I03RikQ9CQ11 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
2010109I03RikQ9CQ11 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
2010109I03RikQ9CQ11 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
2010109I03RikQ9CQ11 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
2010109I03RikQ9CQ11 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
2010109I03RikQ9CQ11 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
2010109I03RikQ9CQ11 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
2010109I03RikQ9CQ11 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
2010109I03RikQ9CQ11 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
2010109I03RikQ9CQ11 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
2010109I03RikQ9CQ11 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
2010109I03RikQ9CQ11 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
2010109I03RikQ9CQ11 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
2010109I03RikQ9CQ11 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
2010109I03RikQ9CQ11 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
2010109I03RikQ9CQ11 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
2010109I03RikQ9CQ11 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
2010109I03RikQ9CQ11 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
2010109I03RikQ9CQ11 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
2010109I03RikQ9CQ11 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
2010109I03RikQ9CQ11 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
2010109I03RikQ9CQ11 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
2010109I03RikQ9CQ11 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
2010109I03RikQ9CQ11 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
2010109I03RikQ9CQ11 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
2010109I03RikQ9CQ11 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
2010109I03RikQ9CQ11 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
2010109I03RikQ9CQ11 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
2010109I03RikQ9CQ11 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
2010109I03RikQ9CQ11 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
2010109I03RikQ9CQ11 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
2010109I03RikQ9CQ11 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
2010109I03RikQ9CQ11 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
2010109I03RikQ9CQ11 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
2010109I03RikQ9CQ11 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
2010109I03RikQ9CQ11 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
2010109I03RikQ9CQ11 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
2010109I03RikQ9CQ11 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
2010109I03RikQ9CQ11 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
2010109I03RikQ9CQ11 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
2010109I03RikQ9CQ11 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
2010109I03RikQ9CQ11 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
2010109I03RikQ9CQ11 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
2010109I03RikQ9CQ11 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
2010109I03RikQ9CQ11 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
2010109I03RikQ9CQ11 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
2010109I03RikQ9CQ11 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
2010109I03RikQ9CQ11 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
2010109I03RikQ9CQ11 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
2010109I03RikQ9CQ11 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
2010109I03RikQ9CQ11 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
2010109I03RikQ9CQ11 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
2010109I03RikQ9CQ11 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
2010109I03RikQ9CQ11 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
2010109I03RikQ9CQ11 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
2010109I03RikQ9CQ11 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
2010109I03RikQ9CQ11 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
2010109I03RikQ9CQ11 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
2010109I03RikQ9CQ11 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
2010109I03RikQ9CQ11 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
2010109I03RikQ9CQ11 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
2010109I03RikQ9CQ11 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
2010109I03RikQ9CQ11 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
2010109I03RikQ9CQ11 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
2010109I03RikQ9CQ11 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms