Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPS8

Small membrane A-kinase anchor protein, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CPS8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q9CPS8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q9CPS8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q9CPS8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q9CPS8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q9CPS8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q9CPS8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q9CPS8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q9CPS8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Q9CPS8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Q9CPS8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Q9CPS8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q9CPS8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q9CPS8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q9CPS8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q9CPS8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q9CPS8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q9CPS8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q9CPS8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Q9CPS8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q9CPS8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q9CPS8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q9CPS8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q9CPS8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q9CPS8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Q9CPS8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q9CPS8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q9CPS8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q9CPS8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q9CPS8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q9CPS8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q9CPS8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Q9CPS8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q9CPS8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q9CPS8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q9CPS8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q9CPS8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q9CPS8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Q9CPS8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q9CPS8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Q9CPS8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Q9CPS8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q9CPS8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q9CPS8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q9CPS8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q9CPS8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q9CPS8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q9CPS8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Q9CPS8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q9CPS8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q9CPS8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q9CPS8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q9CPS8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q9CPS8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q9CPS8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Q9CPS8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Q9CPS8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Q9CPS8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Q9CPS8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q9CPS8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q9CPS8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q9CPS8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q9CPS8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Q9CPS8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q9CPS8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q9CPS8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Q9CPS8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Q9CPS8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Q9CPS8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Q9CPS8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q9CPS8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q9CPS8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q9CPS8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q9CPS8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q9CPS8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q9CPS8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q9CPS8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q9CPS8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q9CPS8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q9CPS8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q9CPS8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q9CPS8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q9CPS8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q9CPS8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Q9CPS8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q9CPS8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q9CPS8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q9CPS8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q9CPS8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Q9CPS8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q9CPS8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q9CPS8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q9CPS8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q9CPS8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q9CPS8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q9CPS8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q9CPS8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q9CPS8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q9CPS8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q9CPS8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
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