Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K1

SLC39A8, Zinc transporter ZIP8, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A8Q9C0K1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC39A8Q9C0K1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC39A8Q9C0K1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC39A8Q9C0K1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC39A8Q9C0K1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC39A8Q9C0K1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC39A8Q9C0K1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC39A8Q9C0K1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC39A8Q9C0K1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC39A8Q9C0K1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC39A8Q9C0K1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC39A8Q9C0K1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC39A8Q9C0K1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC39A8Q9C0K1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC39A8Q9C0K1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC39A8Q9C0K1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC39A8Q9C0K1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC39A8Q9C0K1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC39A8Q9C0K1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC39A8Q9C0K1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC39A8Q9C0K1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC39A8Q9C0K1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC39A8Q9C0K1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC39A8Q9C0K1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC39A8Q9C0K1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC39A8Q9C0K1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC39A8Q9C0K1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC39A8Q9C0K1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC39A8Q9C0K1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC39A8Q9C0K1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC39A8Q9C0K1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC39A8Q9C0K1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC39A8Q9C0K1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC39A8Q9C0K1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC39A8Q9C0K1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC39A8Q9C0K1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC39A8Q9C0K1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC39A8Q9C0K1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC39A8Q9C0K1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC39A8Q9C0K1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC39A8Q9C0K1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC39A8Q9C0K1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC39A8Q9C0K1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC39A8Q9C0K1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC39A8Q9C0K1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC39A8Q9C0K1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC39A8Q9C0K1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC39A8Q9C0K1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC39A8Q9C0K1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC39A8Q9C0K1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC39A8Q9C0K1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC39A8Q9C0K1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC39A8Q9C0K1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC39A8Q9C0K1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC39A8Q9C0K1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SLC39A8Q9C0K1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC39A8Q9C0K1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC39A8Q9C0K1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC39A8Q9C0K1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC39A8Q9C0K1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC39A8Q9C0K1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC39A8Q9C0K1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC39A8Q9C0K1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC39A8Q9C0K1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC39A8Q9C0K1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC39A8Q9C0K1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC39A8Q9C0K1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC39A8Q9C0K1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC39A8Q9C0K1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC39A8Q9C0K1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC39A8Q9C0K1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC39A8Q9C0K1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC39A8Q9C0K1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC39A8Q9C0K1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC39A8Q9C0K1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC39A8Q9C0K1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC39A8Q9C0K1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC39A8Q9C0K1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC39A8Q9C0K1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC39A8Q9C0K1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC39A8Q9C0K1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC39A8Q9C0K1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC39A8Q9C0K1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC39A8Q9C0K1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC39A8Q9C0K1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC39A8Q9C0K1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC39A8Q9C0K1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC39A8Q9C0K1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC39A8Q9C0K1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC39A8Q9C0K1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC39A8Q9C0K1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC39A8Q9C0K1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC39A8Q9C0K1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC39A8Q9C0K1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC39A8Q9C0K1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC39A8Q9C0K1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC39A8Q9C0K1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC39A8Q9C0K1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC39A8Q9C0K1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC39A8Q9C0K1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms