Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D2

CEP295, Centrosomal protein of 295 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP295Q9C0D2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CEP295Q9C0D2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CEP295Q9C0D2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CEP295Q9C0D2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CEP295Q9C0D2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CEP295Q9C0D2 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CEP295Q9C0D2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CEP295Q9C0D2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CEP295Q9C0D2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CEP295Q9C0D2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CEP295Q9C0D2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CEP295Q9C0D2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CEP295Q9C0D2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CEP295Q9C0D2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CEP295Q9C0D2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CEP295Q9C0D2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CEP295Q9C0D2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CEP295Q9C0D2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CEP295Q9C0D2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CEP295Q9C0D2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CEP295Q9C0D2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CEP295Q9C0D2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CEP295Q9C0D2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CEP295Q9C0D2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CEP295Q9C0D2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CEP295Q9C0D2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CEP295Q9C0D2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CEP295Q9C0D2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CEP295Q9C0D2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CEP295Q9C0D2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CEP295Q9C0D2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CEP295Q9C0D2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CEP295Q9C0D2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CEP295Q9C0D2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CEP295Q9C0D2 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CEP295Q9C0D2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CEP295Q9C0D2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CEP295Q9C0D2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CEP295Q9C0D2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CEP295Q9C0D2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CEP295Q9C0D2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CEP295Q9C0D2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CEP295Q9C0D2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CEP295Q9C0D2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CEP295Q9C0D2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CEP295Q9C0D2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CEP295Q9C0D2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CEP295Q9C0D2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CEP295Q9C0D2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CEP295Q9C0D2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CEP295Q9C0D2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CEP295Q9C0D2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CEP295Q9C0D2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CEP295Q9C0D2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CEP295Q9C0D2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CEP295Q9C0D2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CEP295Q9C0D2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CEP295Q9C0D2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CEP295Q9C0D2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CEP295Q9C0D2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CEP295Q9C0D2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CEP295Q9C0D2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CEP295Q9C0D2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CEP295Q9C0D2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CEP295Q9C0D2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CEP295Q9C0D2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CEP295Q9C0D2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CEP295Q9C0D2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CEP295Q9C0D2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CEP295Q9C0D2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CEP295Q9C0D2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CEP295Q9C0D2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CEP295Q9C0D2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CEP295Q9C0D2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CEP295Q9C0D2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CEP295Q9C0D2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CEP295Q9C0D2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CEP295Q9C0D2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CEP295Q9C0D2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CEP295Q9C0D2 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CEP295Q9C0D2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CEP295Q9C0D2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CEP295Q9C0D2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CEP295Q9C0D2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CEP295Q9C0D2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CEP295Q9C0D2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CEP295Q9C0D2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CEP295Q9C0D2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CEP295Q9C0D2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CEP295Q9C0D2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CEP295Q9C0D2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CEP295Q9C0D2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CEP295Q9C0D2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CEP295Q9C0D2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CEP295Q9C0D2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CEP295Q9C0D2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CEP295Q9C0D2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CEP295Q9C0D2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CEP295Q9C0D2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CEP295Q9C0D2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms