Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B9

ZCCHC2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC2Q9C0B9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZCCHC2Q9C0B9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ZCCHC2Q9C0B9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZCCHC2Q9C0B9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZCCHC2Q9C0B9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZCCHC2Q9C0B9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZCCHC2Q9C0B9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZCCHC2Q9C0B9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ZCCHC2Q9C0B9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZCCHC2Q9C0B9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZCCHC2Q9C0B9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZCCHC2Q9C0B9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ZCCHC2Q9C0B9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ZCCHC2Q9C0B9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZCCHC2Q9C0B9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZCCHC2Q9C0B9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ZCCHC2Q9C0B9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZCCHC2Q9C0B9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZCCHC2Q9C0B9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZCCHC2Q9C0B9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZCCHC2Q9C0B9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZCCHC2Q9C0B9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZCCHC2Q9C0B9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZCCHC2Q9C0B9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZCCHC2Q9C0B9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZCCHC2Q9C0B9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZCCHC2Q9C0B9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZCCHC2Q9C0B9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZCCHC2Q9C0B9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZCCHC2Q9C0B9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ZCCHC2Q9C0B9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZCCHC2Q9C0B9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZCCHC2Q9C0B9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZCCHC2Q9C0B9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZCCHC2Q9C0B9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ZCCHC2Q9C0B9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZCCHC2Q9C0B9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZCCHC2Q9C0B9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZCCHC2Q9C0B9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZCCHC2Q9C0B9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZCCHC2Q9C0B9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZCCHC2Q9C0B9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZCCHC2Q9C0B9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZCCHC2Q9C0B9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZCCHC2Q9C0B9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZCCHC2Q9C0B9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZCCHC2Q9C0B9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ZCCHC2Q9C0B9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZCCHC2Q9C0B9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZCCHC2Q9C0B9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZCCHC2Q9C0B9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZCCHC2Q9C0B9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZCCHC2Q9C0B9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZCCHC2Q9C0B9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZCCHC2Q9C0B9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZCCHC2Q9C0B9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZCCHC2Q9C0B9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZCCHC2Q9C0B9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZCCHC2Q9C0B9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZCCHC2Q9C0B9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZCCHC2Q9C0B9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZCCHC2Q9C0B9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZCCHC2Q9C0B9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZCCHC2Q9C0B9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZCCHC2Q9C0B9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZCCHC2Q9C0B9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZCCHC2Q9C0B9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZCCHC2Q9C0B9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZCCHC2Q9C0B9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZCCHC2Q9C0B9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZCCHC2Q9C0B9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZCCHC2Q9C0B9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZCCHC2Q9C0B9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZCCHC2Q9C0B9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ZCCHC2Q9C0B9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ZCCHC2Q9C0B9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZCCHC2Q9C0B9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZCCHC2Q9C0B9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZCCHC2Q9C0B9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZCCHC2Q9C0B9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZCCHC2Q9C0B9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZCCHC2Q9C0B9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZCCHC2Q9C0B9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZCCHC2Q9C0B9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZCCHC2Q9C0B9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZCCHC2Q9C0B9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ZCCHC2Q9C0B9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZCCHC2Q9C0B9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZCCHC2Q9C0B9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZCCHC2Q9C0B9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZCCHC2Q9C0B9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZCCHC2Q9C0B9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZCCHC2Q9C0B9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZCCHC2Q9C0B9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZCCHC2Q9C0B9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZCCHC2Q9C0B9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZCCHC2Q9C0B9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZCCHC2Q9C0B9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ZCCHC2Q9C0B9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZCCHC2Q9C0B9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.1 ms