Protein–RNA interactions for Protein: Q9C093

SPEF2, Sperm flagellar protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPEF2Q9C093 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
SPEF2Q9C093 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
SPEF2Q9C093 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
SPEF2Q9C093 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
SPEF2Q9C093 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
SPEF2Q9C093 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
SPEF2Q9C093 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
SPEF2Q9C093 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
SPEF2Q9C093 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
SPEF2Q9C093 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
SPEF2Q9C093 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
SPEF2Q9C093 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
SPEF2Q9C093 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
SPEF2Q9C093 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
SPEF2Q9C093 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
SPEF2Q9C093 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
SPEF2Q9C093 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
SPEF2Q9C093 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
SPEF2Q9C093 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC31.64■■■□□ 2.66
SPEF2Q9C093 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
SPEF2Q9C093 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
SPEF2Q9C093 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
SPEF2Q9C093 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
SPEF2Q9C093 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
SPEF2Q9C093 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
SPEF2Q9C093 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
SPEF2Q9C093 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
SPEF2Q9C093 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
SPEF2Q9C093 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
SPEF2Q9C093 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
SPEF2Q9C093 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
SPEF2Q9C093 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
SPEF2Q9C093 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
SPEF2Q9C093 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
SPEF2Q9C093 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
SPEF2Q9C093 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
SPEF2Q9C093 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
SPEF2Q9C093 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
SPEF2Q9C093 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
SPEF2Q9C093 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
SPEF2Q9C093 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
SPEF2Q9C093 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
SPEF2Q9C093 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC31.57■■■□□ 2.64
SPEF2Q9C093 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
SPEF2Q9C093 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
SPEF2Q9C093 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
SPEF2Q9C093 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
SPEF2Q9C093 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
SPEF2Q9C093 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
SPEF2Q9C093 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
SPEF2Q9C093 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
SPEF2Q9C093 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
SPEF2Q9C093 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
SPEF2Q9C093 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC31.54■■■□□ 2.64
SPEF2Q9C093 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
SPEF2Q9C093 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
SPEF2Q9C093 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
SPEF2Q9C093 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
SPEF2Q9C093 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC31.52■■■□□ 2.64
SPEF2Q9C093 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC31.52■■■□□ 2.64
SPEF2Q9C093 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
SPEF2Q9C093 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
SPEF2Q9C093 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
SPEF2Q9C093 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
SPEF2Q9C093 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
SPEF2Q9C093 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
SPEF2Q9C093 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
SPEF2Q9C093 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
SPEF2Q9C093 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
SPEF2Q9C093 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC31.51■■■□□ 2.63
SPEF2Q9C093 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
SPEF2Q9C093 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
SPEF2Q9C093 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
SPEF2Q9C093 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
SPEF2Q9C093 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
SPEF2Q9C093 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
SPEF2Q9C093 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
SPEF2Q9C093 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
SPEF2Q9C093 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
SPEF2Q9C093 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
SPEF2Q9C093 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
SPEF2Q9C093 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
SPEF2Q9C093 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
SPEF2Q9C093 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC31.47■■■□□ 2.63
SPEF2Q9C093 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
SPEF2Q9C093 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
SPEF2Q9C093 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC31.46■■■□□ 2.63
SPEF2Q9C093 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
SPEF2Q9C093 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
SPEF2Q9C093 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
SPEF2Q9C093 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.63
SPEF2Q9C093 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
SPEF2Q9C093 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.62
SPEF2Q9C093 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
SPEF2Q9C093 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.62
SPEF2Q9C093 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
SPEF2Q9C093 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
SPEF2Q9C093 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
SPEF2Q9C093 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
SPEF2Q9C093 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms