Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL6

PRKD2, Serine/threonine-protein kinase D2, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD2Q9BZL6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRKD2Q9BZL6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRKD2Q9BZL6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRKD2Q9BZL6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRKD2Q9BZL6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRKD2Q9BZL6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PRKD2Q9BZL6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PRKD2Q9BZL6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRKD2Q9BZL6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRKD2Q9BZL6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRKD2Q9BZL6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRKD2Q9BZL6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRKD2Q9BZL6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRKD2Q9BZL6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRKD2Q9BZL6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRKD2Q9BZL6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PRKD2Q9BZL6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRKD2Q9BZL6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRKD2Q9BZL6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRKD2Q9BZL6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PRKD2Q9BZL6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRKD2Q9BZL6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRKD2Q9BZL6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PRKD2Q9BZL6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRKD2Q9BZL6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PRKD2Q9BZL6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRKD2Q9BZL6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRKD2Q9BZL6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PRKD2Q9BZL6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRKD2Q9BZL6 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRKD2Q9BZL6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRKD2Q9BZL6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRKD2Q9BZL6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRKD2Q9BZL6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRKD2Q9BZL6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRKD2Q9BZL6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRKD2Q9BZL6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRKD2Q9BZL6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRKD2Q9BZL6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PRKD2Q9BZL6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRKD2Q9BZL6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRKD2Q9BZL6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRKD2Q9BZL6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRKD2Q9BZL6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRKD2Q9BZL6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRKD2Q9BZL6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRKD2Q9BZL6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRKD2Q9BZL6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRKD2Q9BZL6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRKD2Q9BZL6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
PRKD2Q9BZL6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRKD2Q9BZL6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRKD2Q9BZL6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRKD2Q9BZL6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRKD2Q9BZL6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRKD2Q9BZL6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRKD2Q9BZL6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRKD2Q9BZL6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRKD2Q9BZL6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRKD2Q9BZL6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRKD2Q9BZL6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRKD2Q9BZL6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PRKD2Q9BZL6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRKD2Q9BZL6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRKD2Q9BZL6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRKD2Q9BZL6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRKD2Q9BZL6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRKD2Q9BZL6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PRKD2Q9BZL6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRKD2Q9BZL6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRKD2Q9BZL6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRKD2Q9BZL6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRKD2Q9BZL6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRKD2Q9BZL6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRKD2Q9BZL6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PRKD2Q9BZL6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRKD2Q9BZL6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRKD2Q9BZL6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRKD2Q9BZL6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRKD2Q9BZL6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PRKD2Q9BZL6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRKD2Q9BZL6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRKD2Q9BZL6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRKD2Q9BZL6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRKD2Q9BZL6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRKD2Q9BZL6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRKD2Q9BZL6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRKD2Q9BZL6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PRKD2Q9BZL6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRKD2Q9BZL6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRKD2Q9BZL6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRKD2Q9BZL6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRKD2Q9BZL6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRKD2Q9BZL6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRKD2Q9BZL6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRKD2Q9BZL6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRKD2Q9BZL6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRKD2Q9BZL6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRKD2Q9BZL6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRKD2Q9BZL6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms