Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZD4

NUF2, Kinetochore protein Nuf2, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUF2Q9BZD4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
NUF2Q9BZD4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NUF2Q9BZD4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NUF2Q9BZD4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NUF2Q9BZD4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NUF2Q9BZD4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NUF2Q9BZD4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NUF2Q9BZD4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NUF2Q9BZD4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NUF2Q9BZD4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NUF2Q9BZD4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NUF2Q9BZD4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NUF2Q9BZD4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NUF2Q9BZD4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUF2Q9BZD4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUF2Q9BZD4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUF2Q9BZD4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUF2Q9BZD4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUF2Q9BZD4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUF2Q9BZD4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUF2Q9BZD4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUF2Q9BZD4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUF2Q9BZD4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUF2Q9BZD4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUF2Q9BZD4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUF2Q9BZD4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUF2Q9BZD4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUF2Q9BZD4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUF2Q9BZD4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUF2Q9BZD4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUF2Q9BZD4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUF2Q9BZD4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NUF2Q9BZD4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUF2Q9BZD4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUF2Q9BZD4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUF2Q9BZD4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUF2Q9BZD4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUF2Q9BZD4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUF2Q9BZD4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUF2Q9BZD4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUF2Q9BZD4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUF2Q9BZD4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUF2Q9BZD4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUF2Q9BZD4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUF2Q9BZD4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUF2Q9BZD4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUF2Q9BZD4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUF2Q9BZD4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUF2Q9BZD4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUF2Q9BZD4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUF2Q9BZD4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUF2Q9BZD4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUF2Q9BZD4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUF2Q9BZD4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUF2Q9BZD4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUF2Q9BZD4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NUF2Q9BZD4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NUF2Q9BZD4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUF2Q9BZD4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUF2Q9BZD4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUF2Q9BZD4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NUF2Q9BZD4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUF2Q9BZD4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUF2Q9BZD4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUF2Q9BZD4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUF2Q9BZD4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NUF2Q9BZD4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUF2Q9BZD4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUF2Q9BZD4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUF2Q9BZD4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUF2Q9BZD4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUF2Q9BZD4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUF2Q9BZD4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUF2Q9BZD4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUF2Q9BZD4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUF2Q9BZD4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUF2Q9BZD4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUF2Q9BZD4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUF2Q9BZD4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NUF2Q9BZD4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NUF2Q9BZD4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NUF2Q9BZD4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NUF2Q9BZD4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUF2Q9BZD4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUF2Q9BZD4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NUF2Q9BZD4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUF2Q9BZD4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUF2Q9BZD4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUF2Q9BZD4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUF2Q9BZD4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUF2Q9BZD4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NUF2Q9BZD4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NUF2Q9BZD4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NUF2Q9BZD4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NUF2Q9BZD4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUF2Q9BZD4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUF2Q9BZD4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUF2Q9BZD4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUF2Q9BZD4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NUF2Q9BZD4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms