Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ0

KRTAP9-8, Keratin-associated protein 9-8, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-8Q9BYQ0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
KRTAP9-8Q9BYQ0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
KRTAP9-8Q9BYQ0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
KRTAP9-8Q9BYQ0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
KRTAP9-8Q9BYQ0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
KRTAP9-8Q9BYQ0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
KRTAP9-8Q9BYQ0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
KRTAP9-8Q9BYQ0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
KRTAP9-8Q9BYQ0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
KRTAP9-8Q9BYQ0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
KRTAP9-8Q9BYQ0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
KRTAP9-8Q9BYQ0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
KRTAP9-8Q9BYQ0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
KRTAP9-8Q9BYQ0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
KRTAP9-8Q9BYQ0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
KRTAP9-8Q9BYQ0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
KRTAP9-8Q9BYQ0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
KRTAP9-8Q9BYQ0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
KRTAP9-8Q9BYQ0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
KRTAP9-8Q9BYQ0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
KRTAP9-8Q9BYQ0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
KRTAP9-8Q9BYQ0 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
KRTAP9-8Q9BYQ0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
KRTAP9-8Q9BYQ0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
KRTAP9-8Q9BYQ0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
KRTAP9-8Q9BYQ0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
KRTAP9-8Q9BYQ0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
KRTAP9-8Q9BYQ0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
KRTAP9-8Q9BYQ0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
KRTAP9-8Q9BYQ0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
KRTAP9-8Q9BYQ0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
KRTAP9-8Q9BYQ0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
KRTAP9-8Q9BYQ0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
KRTAP9-8Q9BYQ0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
KRTAP9-8Q9BYQ0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
KRTAP9-8Q9BYQ0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
KRTAP9-8Q9BYQ0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
KRTAP9-8Q9BYQ0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
KRTAP9-8Q9BYQ0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
KRTAP9-8Q9BYQ0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
KRTAP9-8Q9BYQ0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC12.14□□□□□ -0.47
KRTAP9-8Q9BYQ0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
KRTAP9-8Q9BYQ0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
KRTAP9-8Q9BYQ0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
KRTAP9-8Q9BYQ0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP9-8Q9BYQ0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP9-8Q9BYQ0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP9-8Q9BYQ0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP9-8Q9BYQ0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP9-8Q9BYQ0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP9-8Q9BYQ0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP9-8Q9BYQ0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP9-8Q9BYQ0 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP9-8Q9BYQ0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
KRTAP9-8Q9BYQ0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
KRTAP9-8Q9BYQ0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
KRTAP9-8Q9BYQ0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
KRTAP9-8Q9BYQ0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
KRTAP9-8Q9BYQ0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
KRTAP9-8Q9BYQ0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
KRTAP9-8Q9BYQ0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
KRTAP9-8Q9BYQ0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
KRTAP9-8Q9BYQ0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
KRTAP9-8Q9BYQ0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
KRTAP9-8Q9BYQ0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
KRTAP9-8Q9BYQ0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
KRTAP9-8Q9BYQ0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
KRTAP9-8Q9BYQ0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
KRTAP9-8Q9BYQ0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
KRTAP9-8Q9BYQ0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
KRTAP9-8Q9BYQ0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
KRTAP9-8Q9BYQ0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
KRTAP9-8Q9BYQ0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
KRTAP9-8Q9BYQ0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
KRTAP9-8Q9BYQ0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
KRTAP9-8Q9BYQ0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
KRTAP9-8Q9BYQ0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
KRTAP9-8Q9BYQ0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
KRTAP9-8Q9BYQ0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
KRTAP9-8Q9BYQ0 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
KRTAP9-8Q9BYQ0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
KRTAP9-8Q9BYQ0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
KRTAP9-8Q9BYQ0 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
KRTAP9-8Q9BYQ0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms