Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYJ9

YTHDF1, YTH domain-containing family protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF1Q9BYJ9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
YTHDF1Q9BYJ9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
YTHDF1Q9BYJ9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
YTHDF1Q9BYJ9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
YTHDF1Q9BYJ9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
YTHDF1Q9BYJ9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
YTHDF1Q9BYJ9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
YTHDF1Q9BYJ9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
YTHDF1Q9BYJ9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
YTHDF1Q9BYJ9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
YTHDF1Q9BYJ9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
YTHDF1Q9BYJ9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
YTHDF1Q9BYJ9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
YTHDF1Q9BYJ9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
YTHDF1Q9BYJ9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
YTHDF1Q9BYJ9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
YTHDF1Q9BYJ9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
YTHDF1Q9BYJ9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
YTHDF1Q9BYJ9 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
YTHDF1Q9BYJ9 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
YTHDF1Q9BYJ9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
YTHDF1Q9BYJ9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
YTHDF1Q9BYJ9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
YTHDF1Q9BYJ9 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
YTHDF1Q9BYJ9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
YTHDF1Q9BYJ9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
YTHDF1Q9BYJ9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
YTHDF1Q9BYJ9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
YTHDF1Q9BYJ9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
YTHDF1Q9BYJ9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
YTHDF1Q9BYJ9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
YTHDF1Q9BYJ9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
YTHDF1Q9BYJ9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
YTHDF1Q9BYJ9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
YTHDF1Q9BYJ9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
YTHDF1Q9BYJ9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
YTHDF1Q9BYJ9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
YTHDF1Q9BYJ9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
YTHDF1Q9BYJ9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
YTHDF1Q9BYJ9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
YTHDF1Q9BYJ9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
YTHDF1Q9BYJ9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
YTHDF1Q9BYJ9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
YTHDF1Q9BYJ9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
YTHDF1Q9BYJ9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
YTHDF1Q9BYJ9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
YTHDF1Q9BYJ9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
YTHDF1Q9BYJ9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
YTHDF1Q9BYJ9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
YTHDF1Q9BYJ9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
YTHDF1Q9BYJ9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
YTHDF1Q9BYJ9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
YTHDF1Q9BYJ9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
YTHDF1Q9BYJ9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
YTHDF1Q9BYJ9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
YTHDF1Q9BYJ9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
YTHDF1Q9BYJ9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
YTHDF1Q9BYJ9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
YTHDF1Q9BYJ9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
YTHDF1Q9BYJ9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
YTHDF1Q9BYJ9 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
YTHDF1Q9BYJ9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
YTHDF1Q9BYJ9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
YTHDF1Q9BYJ9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
YTHDF1Q9BYJ9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
YTHDF1Q9BYJ9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
YTHDF1Q9BYJ9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
YTHDF1Q9BYJ9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
YTHDF1Q9BYJ9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
YTHDF1Q9BYJ9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
YTHDF1Q9BYJ9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
YTHDF1Q9BYJ9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
YTHDF1Q9BYJ9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
YTHDF1Q9BYJ9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
YTHDF1Q9BYJ9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
YTHDF1Q9BYJ9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
YTHDF1Q9BYJ9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
YTHDF1Q9BYJ9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
YTHDF1Q9BYJ9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
YTHDF1Q9BYJ9 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
YTHDF1Q9BYJ9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
YTHDF1Q9BYJ9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
YTHDF1Q9BYJ9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
YTHDF1Q9BYJ9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
YTHDF1Q9BYJ9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
YTHDF1Q9BYJ9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
YTHDF1Q9BYJ9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
YTHDF1Q9BYJ9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
YTHDF1Q9BYJ9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
YTHDF1Q9BYJ9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
YTHDF1Q9BYJ9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
YTHDF1Q9BYJ9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
YTHDF1Q9BYJ9 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
YTHDF1Q9BYJ9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
YTHDF1Q9BYJ9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
YTHDF1Q9BYJ9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
YTHDF1Q9BYJ9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
YTHDF1Q9BYJ9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
YTHDF1Q9BYJ9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
YTHDF1Q9BYJ9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.7 ms