Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY50

SEC11C, Signal peptidase complex catalytic subunit SEC11C, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC11CQ9BY50 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEC11CQ9BY50 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEC11CQ9BY50 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEC11CQ9BY50 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEC11CQ9BY50 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEC11CQ9BY50 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEC11CQ9BY50 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEC11CQ9BY50 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEC11CQ9BY50 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEC11CQ9BY50 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEC11CQ9BY50 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEC11CQ9BY50 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEC11CQ9BY50 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEC11CQ9BY50 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEC11CQ9BY50 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEC11CQ9BY50 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SEC11CQ9BY50 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEC11CQ9BY50 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEC11CQ9BY50 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SEC11CQ9BY50 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEC11CQ9BY50 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEC11CQ9BY50 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEC11CQ9BY50 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEC11CQ9BY50 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEC11CQ9BY50 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEC11CQ9BY50 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEC11CQ9BY50 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SEC11CQ9BY50 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
SEC11CQ9BY50 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
SEC11CQ9BY50 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
SEC11CQ9BY50 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SEC11CQ9BY50 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEC11CQ9BY50 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEC11CQ9BY50 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEC11CQ9BY50 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEC11CQ9BY50 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEC11CQ9BY50 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEC11CQ9BY50 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEC11CQ9BY50 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEC11CQ9BY50 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEC11CQ9BY50 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEC11CQ9BY50 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEC11CQ9BY50 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEC11CQ9BY50 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEC11CQ9BY50 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEC11CQ9BY50 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEC11CQ9BY50 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEC11CQ9BY50 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEC11CQ9BY50 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEC11CQ9BY50 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEC11CQ9BY50 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEC11CQ9BY50 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEC11CQ9BY50 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEC11CQ9BY50 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEC11CQ9BY50 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEC11CQ9BY50 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEC11CQ9BY50 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEC11CQ9BY50 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEC11CQ9BY50 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEC11CQ9BY50 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEC11CQ9BY50 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEC11CQ9BY50 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEC11CQ9BY50 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEC11CQ9BY50 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEC11CQ9BY50 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEC11CQ9BY50 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEC11CQ9BY50 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEC11CQ9BY50 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEC11CQ9BY50 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEC11CQ9BY50 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEC11CQ9BY50 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEC11CQ9BY50 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEC11CQ9BY50 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEC11CQ9BY50 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEC11CQ9BY50 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEC11CQ9BY50 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEC11CQ9BY50 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEC11CQ9BY50 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEC11CQ9BY50 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEC11CQ9BY50 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEC11CQ9BY50 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEC11CQ9BY50 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEC11CQ9BY50 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEC11CQ9BY50 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEC11CQ9BY50 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEC11CQ9BY50 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEC11CQ9BY50 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEC11CQ9BY50 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEC11CQ9BY50 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEC11CQ9BY50 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SEC11CQ9BY50 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEC11CQ9BY50 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEC11CQ9BY50 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEC11CQ9BY50 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEC11CQ9BY50 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEC11CQ9BY50 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEC11CQ9BY50 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEC11CQ9BY50 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEC11CQ9BY50 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEC11CQ9BY50 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms