Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
SCAPERQ9BY12 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC39.21■■■■□ 3.87
SCAPERQ9BY12 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
SCAPERQ9BY12 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
SCAPERQ9BY12 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC39.2■■■■□ 3.87
SCAPERQ9BY12 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
SCAPERQ9BY12 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
SCAPERQ9BY12 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.19■■■■□ 3.86
SCAPERQ9BY12 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC39.18■■■■□ 3.86
SCAPERQ9BY12 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
SCAPERQ9BY12 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
SCAPERQ9BY12 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC39.16■■■■□ 3.86
SCAPERQ9BY12 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC39.16■■■■□ 3.86
SCAPERQ9BY12 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
SCAPERQ9BY12 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
SCAPERQ9BY12 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
SCAPERQ9BY12 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.13■■■■□ 3.85
SCAPERQ9BY12 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
SCAPERQ9BY12 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.11■■■■□ 3.85
SCAPERQ9BY12 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
SCAPERQ9BY12 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
SCAPERQ9BY12 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
SCAPERQ9BY12 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
SCAPERQ9BY12 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC39.1■■■■□ 3.85
SCAPERQ9BY12 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC39.1■■■■□ 3.85
SCAPERQ9BY12 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
SCAPERQ9BY12 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
SCAPERQ9BY12 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
SCAPERQ9BY12 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC39.09■■■■□ 3.85
SCAPERQ9BY12 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC39.09■■■■□ 3.85
SCAPERQ9BY12 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
SCAPERQ9BY12 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC39.09■■■■□ 3.85
SCAPERQ9BY12 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC39.08■■■■□ 3.85
SCAPERQ9BY12 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
SCAPERQ9BY12 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.84
SCAPERQ9BY12 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
SCAPERQ9BY12 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
SCAPERQ9BY12 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
SCAPERQ9BY12 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
SCAPERQ9BY12 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC39.06■■■■□ 3.84
SCAPERQ9BY12 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC39.06■■■■□ 3.84
SCAPERQ9BY12 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
SCAPERQ9BY12 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
SCAPERQ9BY12 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
SCAPERQ9BY12 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.04■■■■□ 3.84
SCAPERQ9BY12 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.03■■■■□ 3.84
SCAPERQ9BY12 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.03■■■■□ 3.84
SCAPERQ9BY12 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC39.03■■■■□ 3.84
SCAPERQ9BY12 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
SCAPERQ9BY12 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
SCAPERQ9BY12 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.83
SCAPERQ9BY12 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC38.99■■■■□ 3.83
SCAPERQ9BY12 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
SCAPERQ9BY12 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
SCAPERQ9BY12 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC38.99■■■■□ 3.83
SCAPERQ9BY12 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC38.98■■■■□ 3.83
SCAPERQ9BY12 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
SCAPERQ9BY12 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC38.97■■■■□ 3.83
SCAPERQ9BY12 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC38.97■■■■□ 3.83
SCAPERQ9BY12 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC38.97■■■■□ 3.83
SCAPERQ9BY12 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC38.96■■■■□ 3.83
SCAPERQ9BY12 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC38.96■■■■□ 3.83
SCAPERQ9BY12 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
SCAPERQ9BY12 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
SCAPERQ9BY12 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC38.95■■■■□ 3.83
SCAPERQ9BY12 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC38.95■■■■□ 3.83
SCAPERQ9BY12 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC38.94■■■■□ 3.82
SCAPERQ9BY12 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
SCAPERQ9BY12 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC38.92■■■■□ 3.82
SCAPERQ9BY12 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC38.91■■■■□ 3.82
SCAPERQ9BY12 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC38.91■■■■□ 3.82
SCAPERQ9BY12 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
SCAPERQ9BY12 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
SCAPERQ9BY12 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
SCAPERQ9BY12 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC38.89■■■■□ 3.82
SCAPERQ9BY12 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.89■■■■□ 3.82
SCAPERQ9BY12 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC38.89■■■■□ 3.82
SCAPERQ9BY12 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
SCAPERQ9BY12 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
SCAPERQ9BY12 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
SCAPERQ9BY12 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC38.88■■■■□ 3.81
SCAPERQ9BY12 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC38.88■■■■□ 3.81
SCAPERQ9BY12 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC38.87■■■■□ 3.81
SCAPERQ9BY12 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
SCAPERQ9BY12 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
SCAPERQ9BY12 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC38.84■■■■□ 3.81
SCAPERQ9BY12 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.84■■■■□ 3.81
SCAPERQ9BY12 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC38.83■■■■□ 3.81
SCAPERQ9BY12 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC38.82■■■■□ 3.8
SCAPERQ9BY12 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
SCAPERQ9BY12 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.82■■■■□ 3.8
SCAPERQ9BY12 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
SCAPERQ9BY12 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC38.81■■■■□ 3.8
SCAPERQ9BY12 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
SCAPERQ9BY12 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
SCAPERQ9BY12 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC38.79■■■■□ 3.8
SCAPERQ9BY12 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
SCAPERQ9BY12 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
SCAPERQ9BY12 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC38.79■■■■□ 3.8
SCAPERQ9BY12 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms