Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXS0

COL25A1, Collagen alpha-1(XXV) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL25A1Q9BXS0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
COL25A1Q9BXS0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
COL25A1Q9BXS0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
COL25A1Q9BXS0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
COL25A1Q9BXS0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
COL25A1Q9BXS0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
COL25A1Q9BXS0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
COL25A1Q9BXS0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
COL25A1Q9BXS0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
COL25A1Q9BXS0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
COL25A1Q9BXS0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
COL25A1Q9BXS0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
COL25A1Q9BXS0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
COL25A1Q9BXS0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
COL25A1Q9BXS0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
COL25A1Q9BXS0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
COL25A1Q9BXS0 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
COL25A1Q9BXS0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
COL25A1Q9BXS0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
COL25A1Q9BXS0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
COL25A1Q9BXS0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
COL25A1Q9BXS0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
COL25A1Q9BXS0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
COL25A1Q9BXS0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
COL25A1Q9BXS0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
COL25A1Q9BXS0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
COL25A1Q9BXS0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
COL25A1Q9BXS0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
COL25A1Q9BXS0 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
COL25A1Q9BXS0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
COL25A1Q9BXS0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
COL25A1Q9BXS0 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
COL25A1Q9BXS0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
COL25A1Q9BXS0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
COL25A1Q9BXS0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
COL25A1Q9BXS0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
COL25A1Q9BXS0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
COL25A1Q9BXS0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
COL25A1Q9BXS0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
COL25A1Q9BXS0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
COL25A1Q9BXS0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
COL25A1Q9BXS0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
COL25A1Q9BXS0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
COL25A1Q9BXS0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
COL25A1Q9BXS0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
COL25A1Q9BXS0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
COL25A1Q9BXS0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
COL25A1Q9BXS0 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
COL25A1Q9BXS0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
COL25A1Q9BXS0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
COL25A1Q9BXS0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
COL25A1Q9BXS0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
COL25A1Q9BXS0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
COL25A1Q9BXS0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
COL25A1Q9BXS0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
COL25A1Q9BXS0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
COL25A1Q9BXS0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
COL25A1Q9BXS0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
COL25A1Q9BXS0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
COL25A1Q9BXS0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
COL25A1Q9BXS0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
COL25A1Q9BXS0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
COL25A1Q9BXS0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
COL25A1Q9BXS0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
COL25A1Q9BXS0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
COL25A1Q9BXS0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
COL25A1Q9BXS0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
COL25A1Q9BXS0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
COL25A1Q9BXS0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
COL25A1Q9BXS0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
COL25A1Q9BXS0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
COL25A1Q9BXS0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
COL25A1Q9BXS0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
COL25A1Q9BXS0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
COL25A1Q9BXS0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
COL25A1Q9BXS0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
COL25A1Q9BXS0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
COL25A1Q9BXS0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
COL25A1Q9BXS0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
COL25A1Q9BXS0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
COL25A1Q9BXS0 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
COL25A1Q9BXS0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
COL25A1Q9BXS0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
COL25A1Q9BXS0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
COL25A1Q9BXS0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
COL25A1Q9BXS0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
COL25A1Q9BXS0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
COL25A1Q9BXS0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
COL25A1Q9BXS0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
COL25A1Q9BXS0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
COL25A1Q9BXS0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
COL25A1Q9BXS0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
COL25A1Q9BXS0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
COL25A1Q9BXS0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
COL25A1Q9BXS0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
COL25A1Q9BXS0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
COL25A1Q9BXS0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
COL25A1Q9BXS0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
COL25A1Q9BXS0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
COL25A1Q9BXS0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms