Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXJ1

C1QTNF1, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF1Q9BXJ1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
C1QTNF1Q9BXJ1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
C1QTNF1Q9BXJ1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
C1QTNF1Q9BXJ1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
C1QTNF1Q9BXJ1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
C1QTNF1Q9BXJ1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
C1QTNF1Q9BXJ1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
C1QTNF1Q9BXJ1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
C1QTNF1Q9BXJ1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
C1QTNF1Q9BXJ1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
C1QTNF1Q9BXJ1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
C1QTNF1Q9BXJ1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
C1QTNF1Q9BXJ1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
C1QTNF1Q9BXJ1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
C1QTNF1Q9BXJ1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
C1QTNF1Q9BXJ1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
C1QTNF1Q9BXJ1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
C1QTNF1Q9BXJ1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
C1QTNF1Q9BXJ1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
C1QTNF1Q9BXJ1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
C1QTNF1Q9BXJ1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
C1QTNF1Q9BXJ1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
C1QTNF1Q9BXJ1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
C1QTNF1Q9BXJ1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
C1QTNF1Q9BXJ1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
C1QTNF1Q9BXJ1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
C1QTNF1Q9BXJ1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
C1QTNF1Q9BXJ1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
C1QTNF1Q9BXJ1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
C1QTNF1Q9BXJ1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
C1QTNF1Q9BXJ1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
C1QTNF1Q9BXJ1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
C1QTNF1Q9BXJ1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
C1QTNF1Q9BXJ1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
C1QTNF1Q9BXJ1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
C1QTNF1Q9BXJ1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
C1QTNF1Q9BXJ1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
C1QTNF1Q9BXJ1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
C1QTNF1Q9BXJ1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
C1QTNF1Q9BXJ1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
C1QTNF1Q9BXJ1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
C1QTNF1Q9BXJ1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
C1QTNF1Q9BXJ1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
C1QTNF1Q9BXJ1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
C1QTNF1Q9BXJ1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
C1QTNF1Q9BXJ1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
C1QTNF1Q9BXJ1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
C1QTNF1Q9BXJ1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
C1QTNF1Q9BXJ1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
C1QTNF1Q9BXJ1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
C1QTNF1Q9BXJ1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
C1QTNF1Q9BXJ1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
C1QTNF1Q9BXJ1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
C1QTNF1Q9BXJ1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
C1QTNF1Q9BXJ1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
C1QTNF1Q9BXJ1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
C1QTNF1Q9BXJ1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
C1QTNF1Q9BXJ1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
C1QTNF1Q9BXJ1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
C1QTNF1Q9BXJ1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
C1QTNF1Q9BXJ1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
C1QTNF1Q9BXJ1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
C1QTNF1Q9BXJ1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
C1QTNF1Q9BXJ1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
C1QTNF1Q9BXJ1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
C1QTNF1Q9BXJ1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
C1QTNF1Q9BXJ1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
C1QTNF1Q9BXJ1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
C1QTNF1Q9BXJ1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
C1QTNF1Q9BXJ1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
C1QTNF1Q9BXJ1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
C1QTNF1Q9BXJ1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
C1QTNF1Q9BXJ1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
C1QTNF1Q9BXJ1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
C1QTNF1Q9BXJ1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
C1QTNF1Q9BXJ1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
C1QTNF1Q9BXJ1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
C1QTNF1Q9BXJ1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
C1QTNF1Q9BXJ1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
C1QTNF1Q9BXJ1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
C1QTNF1Q9BXJ1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
C1QTNF1Q9BXJ1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
C1QTNF1Q9BXJ1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
C1QTNF1Q9BXJ1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
C1QTNF1Q9BXJ1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
C1QTNF1Q9BXJ1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
C1QTNF1Q9BXJ1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
C1QTNF1Q9BXJ1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
C1QTNF1Q9BXJ1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
C1QTNF1Q9BXJ1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
C1QTNF1Q9BXJ1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
C1QTNF1Q9BXJ1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
C1QTNF1Q9BXJ1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
C1QTNF1Q9BXJ1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
C1QTNF1Q9BXJ1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
C1QTNF1Q9BXJ1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
C1QTNF1Q9BXJ1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
C1QTNF1Q9BXJ1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
C1QTNF1Q9BXJ1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
C1QTNF1Q9BXJ1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 188.7 ms