Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HIGD2AQ9BW72 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HIGD2AQ9BW72 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HIGD2AQ9BW72 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HIGD2AQ9BW72 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HIGD2AQ9BW72 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HIGD2AQ9BW72 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HIGD2AQ9BW72 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HIGD2AQ9BW72 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HIGD2AQ9BW72 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HIGD2AQ9BW72 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HIGD2AQ9BW72 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HIGD2AQ9BW72 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HIGD2AQ9BW72 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HIGD2AQ9BW72 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HIGD2AQ9BW72 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HIGD2AQ9BW72 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HIGD2AQ9BW72 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HIGD2AQ9BW72 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HIGD2AQ9BW72 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HIGD2AQ9BW72 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HIGD2AQ9BW72 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HIGD2AQ9BW72 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
HIGD2AQ9BW72 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HIGD2AQ9BW72 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HIGD2AQ9BW72 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HIGD2AQ9BW72 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HIGD2AQ9BW72 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HIGD2AQ9BW72 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HIGD2AQ9BW72 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HIGD2AQ9BW72 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HIGD2AQ9BW72 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HIGD2AQ9BW72 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HIGD2AQ9BW72 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HIGD2AQ9BW72 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HIGD2AQ9BW72 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HIGD2AQ9BW72 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HIGD2AQ9BW72 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HIGD2AQ9BW72 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HIGD2AQ9BW72 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HIGD2AQ9BW72 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HIGD2AQ9BW72 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HIGD2AQ9BW72 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HIGD2AQ9BW72 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HIGD2AQ9BW72 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HIGD2AQ9BW72 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HIGD2AQ9BW72 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HIGD2AQ9BW72 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HIGD2AQ9BW72 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HIGD2AQ9BW72 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HIGD2AQ9BW72 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HIGD2AQ9BW72 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HIGD2AQ9BW72 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HIGD2AQ9BW72 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HIGD2AQ9BW72 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HIGD2AQ9BW72 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HIGD2AQ9BW72 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HIGD2AQ9BW72 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HIGD2AQ9BW72 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HIGD2AQ9BW72 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HIGD2AQ9BW72 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HIGD2AQ9BW72 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIGD2AQ9BW72 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIGD2AQ9BW72 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIGD2AQ9BW72 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIGD2AQ9BW72 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIGD2AQ9BW72 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIGD2AQ9BW72 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIGD2AQ9BW72 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIGD2AQ9BW72 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIGD2AQ9BW72 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIGD2AQ9BW72 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HIGD2AQ9BW72 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIGD2AQ9BW72 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIGD2AQ9BW72 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIGD2AQ9BW72 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIGD2AQ9BW72 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIGD2AQ9BW72 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIGD2AQ9BW72 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIGD2AQ9BW72 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIGD2AQ9BW72 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIGD2AQ9BW72 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HIGD2AQ9BW72 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIGD2AQ9BW72 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIGD2AQ9BW72 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIGD2AQ9BW72 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIGD2AQ9BW72 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIGD2AQ9BW72 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HIGD2AQ9BW72 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HIGD2AQ9BW72 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HIGD2AQ9BW72 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HIGD2AQ9BW72 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HIGD2AQ9BW72 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HIGD2AQ9BW72 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HIGD2AQ9BW72 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HIGD2AQ9BW72 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HIGD2AQ9BW72 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HIGD2AQ9BW72 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HIGD2AQ9BW72 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HIGD2AQ9BW72 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 156 ms