Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVV2

FNDC11, Fibronectin type III domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC11Q9BVV2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FNDC11Q9BVV2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FNDC11Q9BVV2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
FNDC11Q9BVV2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FNDC11Q9BVV2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FNDC11Q9BVV2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FNDC11Q9BVV2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FNDC11Q9BVV2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FNDC11Q9BVV2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FNDC11Q9BVV2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FNDC11Q9BVV2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FNDC11Q9BVV2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FNDC11Q9BVV2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FNDC11Q9BVV2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FNDC11Q9BVV2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FNDC11Q9BVV2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FNDC11Q9BVV2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FNDC11Q9BVV2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FNDC11Q9BVV2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FNDC11Q9BVV2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FNDC11Q9BVV2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FNDC11Q9BVV2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FNDC11Q9BVV2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FNDC11Q9BVV2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FNDC11Q9BVV2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FNDC11Q9BVV2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FNDC11Q9BVV2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FNDC11Q9BVV2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FNDC11Q9BVV2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FNDC11Q9BVV2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FNDC11Q9BVV2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FNDC11Q9BVV2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
FNDC11Q9BVV2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FNDC11Q9BVV2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FNDC11Q9BVV2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FNDC11Q9BVV2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FNDC11Q9BVV2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FNDC11Q9BVV2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
FNDC11Q9BVV2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FNDC11Q9BVV2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
FNDC11Q9BVV2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FNDC11Q9BVV2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FNDC11Q9BVV2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FNDC11Q9BVV2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
FNDC11Q9BVV2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FNDC11Q9BVV2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FNDC11Q9BVV2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FNDC11Q9BVV2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FNDC11Q9BVV2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FNDC11Q9BVV2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FNDC11Q9BVV2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FNDC11Q9BVV2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FNDC11Q9BVV2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FNDC11Q9BVV2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FNDC11Q9BVV2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FNDC11Q9BVV2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FNDC11Q9BVV2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FNDC11Q9BVV2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FNDC11Q9BVV2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FNDC11Q9BVV2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FNDC11Q9BVV2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FNDC11Q9BVV2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FNDC11Q9BVV2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FNDC11Q9BVV2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FNDC11Q9BVV2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FNDC11Q9BVV2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FNDC11Q9BVV2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FNDC11Q9BVV2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FNDC11Q9BVV2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FNDC11Q9BVV2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
FNDC11Q9BVV2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FNDC11Q9BVV2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FNDC11Q9BVV2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FNDC11Q9BVV2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FNDC11Q9BVV2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
FNDC11Q9BVV2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FNDC11Q9BVV2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FNDC11Q9BVV2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FNDC11Q9BVV2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
FNDC11Q9BVV2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
FNDC11Q9BVV2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FNDC11Q9BVV2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FNDC11Q9BVV2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FNDC11Q9BVV2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FNDC11Q9BVV2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FNDC11Q9BVV2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FNDC11Q9BVV2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FNDC11Q9BVV2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FNDC11Q9BVV2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FNDC11Q9BVV2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FNDC11Q9BVV2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FNDC11Q9BVV2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FNDC11Q9BVV2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FNDC11Q9BVV2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FNDC11Q9BVV2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
FNDC11Q9BVV2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
FNDC11Q9BVV2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FNDC11Q9BVV2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FNDC11Q9BVV2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FNDC11Q9BVV2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms