Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUZ4

TRAF4, TNF receptor-associated factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4Q9BUZ4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAF4Q9BUZ4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAF4Q9BUZ4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAF4Q9BUZ4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAF4Q9BUZ4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAF4Q9BUZ4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAF4Q9BUZ4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAF4Q9BUZ4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAF4Q9BUZ4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAF4Q9BUZ4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAF4Q9BUZ4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAF4Q9BUZ4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAF4Q9BUZ4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAF4Q9BUZ4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAF4Q9BUZ4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAF4Q9BUZ4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAF4Q9BUZ4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAF4Q9BUZ4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAF4Q9BUZ4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAF4Q9BUZ4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAF4Q9BUZ4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAF4Q9BUZ4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAF4Q9BUZ4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAF4Q9BUZ4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAF4Q9BUZ4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAF4Q9BUZ4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAF4Q9BUZ4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAF4Q9BUZ4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAF4Q9BUZ4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAF4Q9BUZ4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAF4Q9BUZ4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAF4Q9BUZ4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAF4Q9BUZ4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAF4Q9BUZ4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TRAF4Q9BUZ4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TRAF4Q9BUZ4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TRAF4Q9BUZ4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAF4Q9BUZ4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAF4Q9BUZ4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAF4Q9BUZ4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAF4Q9BUZ4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAF4Q9BUZ4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAF4Q9BUZ4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAF4Q9BUZ4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAF4Q9BUZ4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAF4Q9BUZ4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAF4Q9BUZ4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAF4Q9BUZ4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAF4Q9BUZ4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAF4Q9BUZ4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAF4Q9BUZ4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAF4Q9BUZ4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAF4Q9BUZ4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAF4Q9BUZ4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAF4Q9BUZ4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAF4Q9BUZ4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAF4Q9BUZ4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAF4Q9BUZ4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAF4Q9BUZ4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAF4Q9BUZ4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAF4Q9BUZ4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAF4Q9BUZ4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAF4Q9BUZ4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAF4Q9BUZ4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAF4Q9BUZ4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAF4Q9BUZ4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAF4Q9BUZ4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAF4Q9BUZ4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAF4Q9BUZ4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAF4Q9BUZ4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAF4Q9BUZ4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAF4Q9BUZ4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAF4Q9BUZ4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAF4Q9BUZ4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF4Q9BUZ4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF4Q9BUZ4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF4Q9BUZ4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF4Q9BUZ4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAF4Q9BUZ4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAF4Q9BUZ4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAF4Q9BUZ4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAF4Q9BUZ4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAF4Q9BUZ4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAF4Q9BUZ4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAF4Q9BUZ4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAF4Q9BUZ4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAF4Q9BUZ4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAF4Q9BUZ4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAF4Q9BUZ4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAF4Q9BUZ4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAF4Q9BUZ4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAF4Q9BUZ4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAF4Q9BUZ4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAF4Q9BUZ4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAF4Q9BUZ4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAF4Q9BUZ4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAF4Q9BUZ4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAF4Q9BUZ4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAF4Q9BUZ4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAF4Q9BUZ4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms