Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTM1

H2AFJ, Histone H2A.J, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFJQ9BTM1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
H2AFJQ9BTM1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
H2AFJQ9BTM1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
H2AFJQ9BTM1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
H2AFJQ9BTM1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
H2AFJQ9BTM1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
H2AFJQ9BTM1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
H2AFJQ9BTM1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
H2AFJQ9BTM1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
H2AFJQ9BTM1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
H2AFJQ9BTM1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
H2AFJQ9BTM1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
H2AFJQ9BTM1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
H2AFJQ9BTM1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
H2AFJQ9BTM1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
H2AFJQ9BTM1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
H2AFJQ9BTM1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
H2AFJQ9BTM1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
H2AFJQ9BTM1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
H2AFJQ9BTM1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
H2AFJQ9BTM1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
H2AFJQ9BTM1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
H2AFJQ9BTM1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
H2AFJQ9BTM1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
H2AFJQ9BTM1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
H2AFJQ9BTM1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
H2AFJQ9BTM1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
H2AFJQ9BTM1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
H2AFJQ9BTM1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
H2AFJQ9BTM1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
H2AFJQ9BTM1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
H2AFJQ9BTM1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
H2AFJQ9BTM1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
H2AFJQ9BTM1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
H2AFJQ9BTM1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
H2AFJQ9BTM1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
H2AFJQ9BTM1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
H2AFJQ9BTM1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
H2AFJQ9BTM1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
H2AFJQ9BTM1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
H2AFJQ9BTM1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
H2AFJQ9BTM1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
H2AFJQ9BTM1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
H2AFJQ9BTM1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
H2AFJQ9BTM1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
H2AFJQ9BTM1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
H2AFJQ9BTM1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
H2AFJQ9BTM1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
H2AFJQ9BTM1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
H2AFJQ9BTM1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
H2AFJQ9BTM1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
H2AFJQ9BTM1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
H2AFJQ9BTM1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
H2AFJQ9BTM1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
H2AFJQ9BTM1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
H2AFJQ9BTM1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
H2AFJQ9BTM1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
H2AFJQ9BTM1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
H2AFJQ9BTM1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
H2AFJQ9BTM1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
H2AFJQ9BTM1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
H2AFJQ9BTM1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
H2AFJQ9BTM1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
H2AFJQ9BTM1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
H2AFJQ9BTM1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
H2AFJQ9BTM1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
H2AFJQ9BTM1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
H2AFJQ9BTM1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
H2AFJQ9BTM1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
H2AFJQ9BTM1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
H2AFJQ9BTM1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
H2AFJQ9BTM1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
H2AFJQ9BTM1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
H2AFJQ9BTM1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
H2AFJQ9BTM1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
H2AFJQ9BTM1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
H2AFJQ9BTM1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
H2AFJQ9BTM1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
H2AFJQ9BTM1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
H2AFJQ9BTM1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
H2AFJQ9BTM1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
H2AFJQ9BTM1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
H2AFJQ9BTM1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
H2AFJQ9BTM1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
H2AFJQ9BTM1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
H2AFJQ9BTM1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
H2AFJQ9BTM1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
H2AFJQ9BTM1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
H2AFJQ9BTM1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
H2AFJQ9BTM1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
H2AFJQ9BTM1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
H2AFJQ9BTM1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
H2AFJQ9BTM1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
H2AFJQ9BTM1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
H2AFJQ9BTM1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
H2AFJQ9BTM1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
H2AFJQ9BTM1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
H2AFJQ9BTM1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
H2AFJQ9BTM1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
H2AFJQ9BTM1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms