Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GINS3Q9BRX5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GINS3Q9BRX5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GINS3Q9BRX5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GINS3Q9BRX5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GINS3Q9BRX5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GINS3Q9BRX5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GINS3Q9BRX5 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GINS3Q9BRX5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GINS3Q9BRX5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GINS3Q9BRX5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GINS3Q9BRX5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GINS3Q9BRX5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GINS3Q9BRX5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GINS3Q9BRX5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GINS3Q9BRX5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GINS3Q9BRX5 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GINS3Q9BRX5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GINS3Q9BRX5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GINS3Q9BRX5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GINS3Q9BRX5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GINS3Q9BRX5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GINS3Q9BRX5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GINS3Q9BRX5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GINS3Q9BRX5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
GINS3Q9BRX5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GINS3Q9BRX5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GINS3Q9BRX5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GINS3Q9BRX5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GINS3Q9BRX5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GINS3Q9BRX5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GINS3Q9BRX5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GINS3Q9BRX5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GINS3Q9BRX5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GINS3Q9BRX5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GINS3Q9BRX5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GINS3Q9BRX5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GINS3Q9BRX5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GINS3Q9BRX5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GINS3Q9BRX5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GINS3Q9BRX5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GINS3Q9BRX5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GINS3Q9BRX5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GINS3Q9BRX5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GINS3Q9BRX5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GINS3Q9BRX5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GINS3Q9BRX5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GINS3Q9BRX5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GINS3Q9BRX5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GINS3Q9BRX5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GINS3Q9BRX5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GINS3Q9BRX5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GINS3Q9BRX5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GINS3Q9BRX5 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GINS3Q9BRX5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GINS3Q9BRX5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GINS3Q9BRX5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GINS3Q9BRX5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GINS3Q9BRX5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GINS3Q9BRX5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GINS3Q9BRX5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GINS3Q9BRX5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GINS3Q9BRX5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GINS3Q9BRX5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GINS3Q9BRX5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GINS3Q9BRX5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GINS3Q9BRX5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GINS3Q9BRX5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GINS3Q9BRX5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GINS3Q9BRX5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GINS3Q9BRX5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GINS3Q9BRX5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
GINS3Q9BRX5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GINS3Q9BRX5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GINS3Q9BRX5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GINS3Q9BRX5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GINS3Q9BRX5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GINS3Q9BRX5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GINS3Q9BRX5 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GINS3Q9BRX5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GINS3Q9BRX5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GINS3Q9BRX5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GINS3Q9BRX5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GINS3Q9BRX5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GINS3Q9BRX5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GINS3Q9BRX5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GINS3Q9BRX5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GINS3Q9BRX5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GINS3Q9BRX5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GINS3Q9BRX5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GINS3Q9BRX5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GINS3Q9BRX5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GINS3Q9BRX5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GINS3Q9BRX5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GINS3Q9BRX5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GINS3Q9BRX5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GINS3Q9BRX5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GINS3Q9BRX5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GINS3Q9BRX5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
GINS3Q9BRX5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms