Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRT9

GINS4, DNA replication complex GINS protein SLD5, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS4Q9BRT9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GINS4Q9BRT9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GINS4Q9BRT9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GINS4Q9BRT9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GINS4Q9BRT9 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GINS4Q9BRT9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GINS4Q9BRT9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
GINS4Q9BRT9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
GINS4Q9BRT9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GINS4Q9BRT9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GINS4Q9BRT9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GINS4Q9BRT9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GINS4Q9BRT9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GINS4Q9BRT9 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GINS4Q9BRT9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GINS4Q9BRT9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GINS4Q9BRT9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GINS4Q9BRT9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GINS4Q9BRT9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GINS4Q9BRT9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GINS4Q9BRT9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GINS4Q9BRT9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GINS4Q9BRT9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GINS4Q9BRT9 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GINS4Q9BRT9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GINS4Q9BRT9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GINS4Q9BRT9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GINS4Q9BRT9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GINS4Q9BRT9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GINS4Q9BRT9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GINS4Q9BRT9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GINS4Q9BRT9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
GINS4Q9BRT9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GINS4Q9BRT9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GINS4Q9BRT9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GINS4Q9BRT9 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GINS4Q9BRT9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GINS4Q9BRT9 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GINS4Q9BRT9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GINS4Q9BRT9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GINS4Q9BRT9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GINS4Q9BRT9 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GINS4Q9BRT9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GINS4Q9BRT9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GINS4Q9BRT9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GINS4Q9BRT9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GINS4Q9BRT9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
GINS4Q9BRT9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GINS4Q9BRT9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GINS4Q9BRT9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GINS4Q9BRT9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GINS4Q9BRT9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GINS4Q9BRT9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GINS4Q9BRT9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GINS4Q9BRT9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GINS4Q9BRT9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GINS4Q9BRT9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GINS4Q9BRT9 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GINS4Q9BRT9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GINS4Q9BRT9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GINS4Q9BRT9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GINS4Q9BRT9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GINS4Q9BRT9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GINS4Q9BRT9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GINS4Q9BRT9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GINS4Q9BRT9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GINS4Q9BRT9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GINS4Q9BRT9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GINS4Q9BRT9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GINS4Q9BRT9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GINS4Q9BRT9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GINS4Q9BRT9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GINS4Q9BRT9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GINS4Q9BRT9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GINS4Q9BRT9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GINS4Q9BRT9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GINS4Q9BRT9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GINS4Q9BRT9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GINS4Q9BRT9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GINS4Q9BRT9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GINS4Q9BRT9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GINS4Q9BRT9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GINS4Q9BRT9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GINS4Q9BRT9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GINS4Q9BRT9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GINS4Q9BRT9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GINS4Q9BRT9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GINS4Q9BRT9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GINS4Q9BRT9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GINS4Q9BRT9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GINS4Q9BRT9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GINS4Q9BRT9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GINS4Q9BRT9 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GINS4Q9BRT9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GINS4Q9BRT9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GINS4Q9BRT9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GINS4Q9BRT9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GINS4Q9BRT9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GINS4Q9BRT9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GINS4Q9BRT9 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms