Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MESP1Q9BRJ9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MESP1Q9BRJ9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MESP1Q9BRJ9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MESP1Q9BRJ9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MESP1Q9BRJ9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MESP1Q9BRJ9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MESP1Q9BRJ9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MESP1Q9BRJ9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MESP1Q9BRJ9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MESP1Q9BRJ9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MESP1Q9BRJ9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MESP1Q9BRJ9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MESP1Q9BRJ9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MESP1Q9BRJ9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MESP1Q9BRJ9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MESP1Q9BRJ9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MESP1Q9BRJ9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MESP1Q9BRJ9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MESP1Q9BRJ9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MESP1Q9BRJ9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MESP1Q9BRJ9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MESP1Q9BRJ9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
MESP1Q9BRJ9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
MESP1Q9BRJ9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MESP1Q9BRJ9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MESP1Q9BRJ9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MESP1Q9BRJ9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MESP1Q9BRJ9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MESP1Q9BRJ9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MESP1Q9BRJ9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MESP1Q9BRJ9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MESP1Q9BRJ9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MESP1Q9BRJ9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
MESP1Q9BRJ9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MESP1Q9BRJ9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MESP1Q9BRJ9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MESP1Q9BRJ9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MESP1Q9BRJ9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MESP1Q9BRJ9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MESP1Q9BRJ9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MESP1Q9BRJ9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MESP1Q9BRJ9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MESP1Q9BRJ9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MESP1Q9BRJ9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MESP1Q9BRJ9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MESP1Q9BRJ9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MESP1Q9BRJ9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MESP1Q9BRJ9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MESP1Q9BRJ9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MESP1Q9BRJ9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MESP1Q9BRJ9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
MESP1Q9BRJ9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MESP1Q9BRJ9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MESP1Q9BRJ9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MESP1Q9BRJ9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MESP1Q9BRJ9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MESP1Q9BRJ9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MESP1Q9BRJ9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MESP1Q9BRJ9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
MESP1Q9BRJ9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
MESP1Q9BRJ9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MESP1Q9BRJ9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MESP1Q9BRJ9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MESP1Q9BRJ9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MESP1Q9BRJ9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MESP1Q9BRJ9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MESP1Q9BRJ9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MESP1Q9BRJ9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MESP1Q9BRJ9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MESP1Q9BRJ9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MESP1Q9BRJ9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MESP1Q9BRJ9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MESP1Q9BRJ9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MESP1Q9BRJ9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MESP1Q9BRJ9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MESP1Q9BRJ9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MESP1Q9BRJ9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MESP1Q9BRJ9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MESP1Q9BRJ9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MESP1Q9BRJ9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MESP1Q9BRJ9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MESP1Q9BRJ9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
MESP1Q9BRJ9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MESP1Q9BRJ9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MESP1Q9BRJ9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MESP1Q9BRJ9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MESP1Q9BRJ9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MESP1Q9BRJ9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MESP1Q9BRJ9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MESP1Q9BRJ9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MESP1Q9BRJ9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MESP1Q9BRJ9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MESP1Q9BRJ9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MESP1Q9BRJ9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MESP1Q9BRJ9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MESP1Q9BRJ9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MESP1Q9BRJ9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MESP1Q9BRJ9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MESP1Q9BRJ9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms