Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRG1

VPS25, Vacuolar protein-sorting-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS25Q9BRG1 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VPS25Q9BRG1 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VPS25Q9BRG1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VPS25Q9BRG1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VPS25Q9BRG1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VPS25Q9BRG1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VPS25Q9BRG1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VPS25Q9BRG1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VPS25Q9BRG1 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VPS25Q9BRG1 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VPS25Q9BRG1 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VPS25Q9BRG1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
VPS25Q9BRG1 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VPS25Q9BRG1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VPS25Q9BRG1 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VPS25Q9BRG1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
VPS25Q9BRG1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VPS25Q9BRG1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
VPS25Q9BRG1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VPS25Q9BRG1 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
VPS25Q9BRG1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VPS25Q9BRG1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VPS25Q9BRG1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VPS25Q9BRG1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VPS25Q9BRG1 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VPS25Q9BRG1 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VPS25Q9BRG1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VPS25Q9BRG1 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VPS25Q9BRG1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VPS25Q9BRG1 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VPS25Q9BRG1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VPS25Q9BRG1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VPS25Q9BRG1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VPS25Q9BRG1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VPS25Q9BRG1 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VPS25Q9BRG1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VPS25Q9BRG1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VPS25Q9BRG1 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VPS25Q9BRG1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VPS25Q9BRG1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VPS25Q9BRG1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VPS25Q9BRG1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VPS25Q9BRG1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VPS25Q9BRG1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VPS25Q9BRG1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VPS25Q9BRG1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VPS25Q9BRG1 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VPS25Q9BRG1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VPS25Q9BRG1 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VPS25Q9BRG1 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VPS25Q9BRG1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
VPS25Q9BRG1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VPS25Q9BRG1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VPS25Q9BRG1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
VPS25Q9BRG1 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VPS25Q9BRG1 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VPS25Q9BRG1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VPS25Q9BRG1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VPS25Q9BRG1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VPS25Q9BRG1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VPS25Q9BRG1 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VPS25Q9BRG1 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VPS25Q9BRG1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VPS25Q9BRG1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VPS25Q9BRG1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VPS25Q9BRG1 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VPS25Q9BRG1 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VPS25Q9BRG1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VPS25Q9BRG1 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VPS25Q9BRG1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VPS25Q9BRG1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
VPS25Q9BRG1 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VPS25Q9BRG1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VPS25Q9BRG1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VPS25Q9BRG1 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VPS25Q9BRG1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VPS25Q9BRG1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VPS25Q9BRG1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
VPS25Q9BRG1 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VPS25Q9BRG1 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VPS25Q9BRG1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VPS25Q9BRG1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VPS25Q9BRG1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VPS25Q9BRG1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VPS25Q9BRG1 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VPS25Q9BRG1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VPS25Q9BRG1 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VPS25Q9BRG1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VPS25Q9BRG1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VPS25Q9BRG1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VPS25Q9BRG1 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VPS25Q9BRG1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VPS25Q9BRG1 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
VPS25Q9BRG1 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
VPS25Q9BRG1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VPS25Q9BRG1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VPS25Q9BRG1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VPS25Q9BRG1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VPS25Q9BRG1 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VPS25Q9BRG1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms