Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRF8

CPPED1, Serine/threonine-protein phosphatase CPPED1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPPED1Q9BRF8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CPPED1Q9BRF8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CPPED1Q9BRF8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CPPED1Q9BRF8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CPPED1Q9BRF8 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CPPED1Q9BRF8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CPPED1Q9BRF8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CPPED1Q9BRF8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CPPED1Q9BRF8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CPPED1Q9BRF8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CPPED1Q9BRF8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CPPED1Q9BRF8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CPPED1Q9BRF8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CPPED1Q9BRF8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CPPED1Q9BRF8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CPPED1Q9BRF8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CPPED1Q9BRF8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CPPED1Q9BRF8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CPPED1Q9BRF8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CPPED1Q9BRF8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CPPED1Q9BRF8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CPPED1Q9BRF8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CPPED1Q9BRF8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CPPED1Q9BRF8 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CPPED1Q9BRF8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CPPED1Q9BRF8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CPPED1Q9BRF8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CPPED1Q9BRF8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CPPED1Q9BRF8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CPPED1Q9BRF8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CPPED1Q9BRF8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CPPED1Q9BRF8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CPPED1Q9BRF8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CPPED1Q9BRF8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CPPED1Q9BRF8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CPPED1Q9BRF8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CPPED1Q9BRF8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CPPED1Q9BRF8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CPPED1Q9BRF8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CPPED1Q9BRF8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CPPED1Q9BRF8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CPPED1Q9BRF8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CPPED1Q9BRF8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CPPED1Q9BRF8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CPPED1Q9BRF8 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CPPED1Q9BRF8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CPPED1Q9BRF8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CPPED1Q9BRF8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CPPED1Q9BRF8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CPPED1Q9BRF8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CPPED1Q9BRF8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CPPED1Q9BRF8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CPPED1Q9BRF8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CPPED1Q9BRF8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CPPED1Q9BRF8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CPPED1Q9BRF8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CPPED1Q9BRF8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CPPED1Q9BRF8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CPPED1Q9BRF8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CPPED1Q9BRF8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CPPED1Q9BRF8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CPPED1Q9BRF8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CPPED1Q9BRF8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CPPED1Q9BRF8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CPPED1Q9BRF8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CPPED1Q9BRF8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CPPED1Q9BRF8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CPPED1Q9BRF8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CPPED1Q9BRF8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CPPED1Q9BRF8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CPPED1Q9BRF8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CPPED1Q9BRF8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CPPED1Q9BRF8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CPPED1Q9BRF8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CPPED1Q9BRF8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CPPED1Q9BRF8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CPPED1Q9BRF8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CPPED1Q9BRF8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CPPED1Q9BRF8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CPPED1Q9BRF8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CPPED1Q9BRF8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CPPED1Q9BRF8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CPPED1Q9BRF8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CPPED1Q9BRF8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CPPED1Q9BRF8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CPPED1Q9BRF8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CPPED1Q9BRF8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CPPED1Q9BRF8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CPPED1Q9BRF8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CPPED1Q9BRF8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CPPED1Q9BRF8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CPPED1Q9BRF8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CPPED1Q9BRF8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CPPED1Q9BRF8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CPPED1Q9BRF8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CPPED1Q9BRF8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CPPED1Q9BRF8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CPPED1Q9BRF8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CPPED1Q9BRF8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CPPED1Q9BRF8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms